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中国科学院武汉植物园等在菱属泛基因组和结构变异研究中获进展（图）
武汉植物园 菱属泛基因 结构变异
2023/10/23
水稻、玉米和小麦是三大主粮作物，但主粮来源单一成为粮食安全和营养安全的隐患，因此对“孤儿作物”（orphan crop）的重视利用是应对粮食安全危机的有效手段之一。然而，随着城乡现代化进程的持续推进和现代集约化农业的快速发展，“孤儿作物”野生种和地方品种资源正日趋减少，与主粮作物相比，其种质资源的研究及现代育种技术的应用滞后。菱角是典型的“孤儿作物”。新石器时代以来，长江流域的先民开始有意识地大规...
植物所科研人员开发了基因组组装质量评估和改进的新方法（图）
基因 质量评估 光学图谱
2023/11/10
2023年来，随着测序技术和算法的开发，大量动植物基因组被陆续测序和组装，但是基因组组装质量参差不齐，存在不同程度的组装错误，影响了后续的相关研究。高质量的参考基因组对于基因的精准注释和功能研究以及比较基因组学和调控元件的挖掘等至关重要。虽然目前已经有一些基因组组装质量评估的方法，然而它们大多数仅提供了一个概述性的评估值，没有能够针对特定区域设置特定碱基给出精准度的评估。
北京基因组所（国家生物信息中心）发布热带作物组学数据库TCOD（图）
数据库 资源 基因
2023/11/21
热带作物是热带农业的重要组成部分，具有资源稀缺性、功能多样性和广泛的市场需求，为全球热带农业生产国提供了相当可观的经济收入。测序技术的飞速发展推动了热带作物研究领域里程碑式的发展，积累了海量的多组学数据。然而，大量的数据分散在不同的数据中心或网站，给数据利用带来了不便。因此，亟需开发一个综合数据整合与共享平台，为研究人员提供良好的数据查找和在线分析服务。
植物基因组学与新绿色革命论坛：Atypical disease resistance genes across the genome of wheat（2023.10.23日10:00）
植物基因组学 新绿色革命 麦类作物
2023/10/28
植物基因组学与新绿色革命论坛：Atypical disease resistance genes across the genome of wheat（2023.10.23日10:00）。
水稻、玉米和小麦为三大主粮作物，占据了世界粮食产量的 80%以上，主粮来源单一也成为全球粮食安全和营养安全的隐患，对“孤儿作物”（orphan crop）的重视利用是应对粮食安全危机的有效手段之一。然而，随着城乡现代化进程的持续推进和现代集约化农业的快速发展，“孤儿作物”野生种和地方品种资源正日趋减少，与主粮作物相比，其种质资源的研究及现代育种技术的应用严重滞后。菱角就是一种典型的“孤儿作物”，自...
北京基因组所（国家生物信息中心）发布植物图像及相关性状开放归档库（图）
植物图像 植物病虫害 资源
2023/11/21
植物图像包含非常丰富的信息，可以反映植物的颜色、形态、生长和健康状态等关键表型特征。高通量植物表型采集技术在植物表型组学研究中广泛应用，产生了大量的图像和基于图像的性状数据，这些数据是种质筛选、植物病虫害鉴定、农艺性状挖掘等应用的重要资源。构建植物图像及相关性状数据管理平台，提供植物图像及相关性状数据的集中管理、分析和共享，不仅有利于数据的查询、访问、互操作和重复利用，还有助于图像的元信息与表型数...
中国科学院北京基因组研究所开发出比较群体基因组学新算法（图）
基因组测序 基因组学 新算法
2023/10/17
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而，目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中，关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据，成为方法学方面的迫切要求。
中国遗传学会基因组编辑分会第四次会员代表大会暨全国学术年会第三轮通知（图）
中国遗传学会 基因组编 第三轮通知
2023/10/27
由上海科技大学生命科学与技术学院和中国遗传学会基因组编辑分会联合主办的"中国遗传学会基因组编辑分会第四次会员代表大会暨全国学术年会"将于2023年10月26-29日在上海科技大学会议中心召开，会议规模约600~800人。会议将邀请基因编辑相关研究领域的专家对基因编辑技术研发新进展、基因编辑工具相关机理研究、基因编辑在疾病治疗探索、动植物和微生物中的应用研究等方面进行研讨和交流。大会组委会热忱欢迎各...
中国科学院北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法（图）
群体基因 高性能地分析
2023/10/23
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而，目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中，关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据，成为方法学方面的迫切要求。
第二届国际种群基因组学培训班举办（图）
种群 基因组学 培训班 遗传
2024/5/10
2023年10月9日至15日，第二届国际种群基因组学培训班在中国科学院西双版纳热带植物园（以下简称“版纳植物园”）举办。本次培训由版纳植物园、中国科学院上海免疫与感染研究所和复旦大学联合举办，北京诺禾致源科技股份有限公司支持。
近日，西北农林科技大学植物保护学院作物病原真菌功能基因组学研究团队在美国国家科学院院刊《PNAS》上在线发表了题为“A non-pheromone GPCR is essential for meiosis and ascosporogenesis in the wheat scab fungus”的研究论文。该研究率先发现了对小麦赤霉菌有性生殖（初侵染源形成）所必需的新型非信息素依赖的G蛋白偶联...
2023年10月16日，《自然—遗传》杂志（Nature Genetics）在线发表了华中农业大学棉花遗传改良团队的研究论文“Regulatory controls of duplicated gene expression during fiber development in allotetraploid cotton”。该研究解析了异源四倍体陆地棉两个亚基因组对纤维发育和品质形成的动态协同调...
华中农业大学亚基因组协同转录调控解锁棉花纤维品质改良潜力（图）
基因 棉花纤维 品质改良 育种理念
2023/11/12
2023年10月16日，《自然—遗传》杂志（Nature Genetics）在线发表了华中农业大学棉花遗传改良团队的研究论文“Regulatory controls of duplicated gene expression during fiber development in allotetraploid cotton”。该研究解析了异源四倍体陆地棉两个亚基因组对纤维发育和品质形成的动态协同调...
北京基因组所（国家生物信息中心）开发比较群体基因组学新算法（图）
群体基因 高性能地分析
2023/11/21
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为从基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了前所未有的机遇。但是，目前的分析方法面临着一些技术瓶颈和挑战，其中一个关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。另一方面，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据也成为方法学方面的迫切要求。
中国科学院动物研究所研究揭示人类基因组中的“年轻化”基因（图）
人类基因组 “年轻化”基因 基因工程
2023/10/17
随着人口老龄化的到来，衰老相关疾病的高发正成为健康挑战。延缓衰老以及增强衰老组织活力和功能维持，进而促进老年健康是亟待解决的科学难题。细胞衰老（cellular senescence）是器官衰老乃至机体功能退行的本质特征和内在驱动力，为老年慢病提供了机制框架和干预思路。如何延缓甚至逆转细胞衰老，已成为生命科学领域最前沿的科学问题之一。