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云南农业大学甘蔗资源研究取得新进展——甘蔗最小基因组测序与解析（图）
甘蔗 最小基因组 测序 解析
2024/2/26
近日，以云南农业大学为通讯单位，以国内外相关科研院所、实验室等为合作单位，以李富生教授和董扬教授为共同通讯作者，以奎玲副教授、Aasim Majeed博士、王先宏副教授为共同第一作者，利用转录组、基因组、重测序结合生态繁育等技术对甘蔗近缘野生种——蔗茅（Erianthus fulvus，E. fulvus，2n=2X=20）开展研究的成果，以题为A chromosome-level genome ...
紫杉醇是目前已发现的最优秀的天然抗癌药物。紫杉醇生物合成途径已经研究了30多年，而超大的基因组和复杂的代谢路线是途径解析的主要限制因素。中国科学院天津工业生物技术研究所与西北工业大学、深圳华大生命科学研究院、欣贝莱生物等合作，首次完成了喜马拉雅红豆杉超10Gb的染色体水平的全基因组测序，并通过复杂基因组组装与分析，解析了红豆杉中生物合成紫杉醇的关键基因簇，对紫杉醇合成途径的起源与进化机制进行了探索...
最大规模癌症全基因组测序发现致癌新突变
癌细胞基因 计算生物学 DNA碱基
2023/6/8
2023年4月22日，《科学》发表的一项大规模研究分析了12000多名患者癌细胞基因组中隐藏的数亿个突变，筛选确定了几十个新的DNA突变特征，这些特征可能为癌症的遗传和环境原因提供线索。在某些情况下，这也可能帮助临床医生为病人选择最佳的个人治疗方法。
迄今为止最完整的人类基因组测序结果正式发布
人类基因组测序 人类基因变异 GRCh38 T2T-CHM13
2022/4/22
近日，《科学》杂志连发6篇论文，公布迄今为止最完整的人类基因组测序结果，这也是第一个完整无间隙的人类基因组序列。该系列研究主要由国际科学团队端粒到端粒联盟（T2T，Telomere-to-Telomere）完成，联盟成员包括美国国家人类基因组研究所、加州大学圣克鲁兹分校、华盛顿大学等。2003年科学家宣布人类基因组的完整序列时，其实并不准确，有大约8％的基因组从未被完全测序。新完成的基因组被称为T...
宏基因组测序揭示慢性腹泻猕猴肠道微生物及其耐药性的显著变化（图）
慢性腹泻 猕猴 微生物 灵长类动物
2024/3/5
普通猕猴（Macaca mulatta）是我国种群数量最丰富的非人灵长类动物，也是生物医学研究中重要的模式动物。人类和圈养猕猴都存在慢性腹泻，并导致肠炎症和反复腹泻，从而会严重影响人和猕猴的生长发育。慢性腹泻在我国圈养猕猴，特别是在幼年猕猴中存在着较高的发病率和死亡率。为了解肠道微生物在慢性腹泻猕猴中的作用机制，并为人类腹泻提供重要的疾病模型，四川大学灵长类动物研究团队通过对一个圈养猕猴种群的长期...
科技日报讯 （记者张晔 通讯员南医宣）1月8日，“中华基因组计划—姑苏”项目在南京启动。该项目以江苏地区人群为基础，辐射国内其他多个地区人群，开展涵盖全国50万人的全基因组测序，最终建成支撑我国生命医药领域发展、国际领先的大型中国人群健康和生物组学数据共享平台。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合发表植物基因组测序20周年重要综述文章（图）
植物基因 作物遗传育种
2022/10/17
2021年11月12日，基因组所联合浙江大学、中国水稻研究所、澳大利亚CSIRO研究组在《植物科学趋势（Trends in Plant Science）》在线发表了题为“Twenty years of plant genome sequencing: achievements and challenges”的综述论文。论文通过检索和分析上千篇基因组相关文章，系统总结了自2000年以来，这20多年间...
基因组测序揭示紫苏起源进化并助力新品种开发
紫苏起源 风寒感冒 咳嗽呕吐 鱼蟹中毒
2022/6/22
紫苏早在战国时期的《尔雅》中就有“苏，桂荏”的描述，作为第一批列入“药食同源名录”的植物，紫苏既用于治疗风寒感冒、咳嗽呕吐、鱼蟹中毒等，亦常用于生鲜烹饪、寿司制作、腌渍上色等。紫苏有红绿两种叶色，国外常用作园艺图案的布设植物。α-亚麻酸是人体无法自身合成的必须脂肪酸，只能从膳食中获得，但主要油料作物如大豆、花生、油菜中α-亚麻酸的含量很低。紫苏是陆生植物中α-亚麻酸含量最高的物种之一，其种子油脂中...
基因组测序证实长江流域为中国李原始驯化中心（图）
中国农业科学院郑州果树研究所 基因组测序 长江流域 中国李 原始驯化中心
2021/9/11
中国李是世界上商业化栽培最广泛的李种之一，适应性强，具有较高的经济价值与生态价值。近日，中国农业科学院郑州果树研究所李杏种质改良团队与桃种质资源团队联合破译了中国李高质量基因组，为其重要经济性状改良奠定遗传学基础，相关成果9月2日发表于《植物学杂志（The Plant Journal）》。
2021年9月1日，胃肠病学领域学术期刊Gastroenterology以长文形式在线发表了北京大学第一医院肿瘤转化研究中心、天津肿瘤医院张宁课题组的研究成果。在题为“Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma”的研究论文中，研究人员综合...
温带荒漠生态系统是典型的脆弱生态系统，其稳定性的维持与改善关系着我国西部乃至全国的农业及生态安全，是我国生态文明建设的重点内容。通过对不同水热环境沙漠中植物局域适应性分化驱动机制的研究，不仅能全面挖掘抗逆遗传资源，还能进一步预测未来全球气候变化下荒漠植物的响应方式，为温带荒漠生态系统稳定性的维持和改善提供合理有效的理论指导。沙蓬（Agriophyllum squarrosum (L.) Moq.）...
紫杉醇是目前已发现的最优秀的天然抗癌药物。紫杉醇生物合成途径已研究多年，而超大的基因组和复杂的代谢路线是途径解析的主要限制因素。中国科学院天津工业生物技术研究所与西北工业大学、深圳华大生命科学研究院等合作，首次完成了喜马拉雅红豆杉超10Gb的染色体水平的全基因组测序，并通过复杂基因组组装与分析，解析了红豆杉中生物合成紫杉醇的关键基因簇，探索了紫杉醇合成途径的起源与进化机制，为完全解析紫杉醇生物合成...
近日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室喻子牛团队首次在国际上完成了鹦鹉螺全基因组测序，揭示了这种古老软体动物的进化规律、针孔眼形成和生物矿化机制。相关研究成果以论文“The genome of Nautilus pompilius illuminates eye evolution and biomineralization”于2021年5月10日在线发...
近日，Horticulture Research在线发表了西北农林科技大学葡萄种质资源与育种团队王西平课题组题为“Whole genome sequencing reveals rare off-target mutations in CRISPR/Cas9-edited grapevine”的研究论文。青年教师王现行与涂明星博士为该文第一作者，王西平教授为通讯作者。
