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海洋所发表热带骨条藻高质量染色体水平参考基因组（图）
高质量染色体 基因 生态系统
2024/4/27
2024年4月26日，中国科学院海洋研究所陈楠生课题组在硅藻基因组学研究方面取得新进展，成功构建了首个热带骨条藻（Skeletonema tropicum）的高质量染色体水平参考基因组，相关研究成果发表在国际数据集期刊Scientific Data（Q1，IF=9.8）。这是该团队在2023年成功构建海洋优势浮游植物玛氏骨条藻（Skeletonema marinoi）染色体水平基因组之后完成的第二...
巨核细胞（Megakaryocyte，MK）是骨髓中产生血小板的血细胞，血小板在止血、伤口愈合以及炎症反应中具有重要的作用。然而目前血小板输注完全依赖于健康供者捐献，随着血小板输注需求量的增加，供者来源短缺，血小板难以在体外长期保存，血小板的输注存在巨大的供应缺口。而巨核细胞的多倍体化对于血小板产生非常重要，是高效生成功能性血小板的重要保障。因此解析巨核细胞多倍体化调控机制对于突破血小板再生技术瓶...
自30年前“人类基因组计划”（HGP）启动以来，完整和准确的参考基因组一直是生物医学研究领域致力追求的目标。2022年4月，Science期刊发表了首个人类端粒到端粒（T2T）完整基因组——T2T-CHM13，填补了GRCh38版本中剩余的8%人类基因组序列空白，成为有史以来第一个高质量的单倍体人类基因组。2024年来研究证实人种之间存在显著的基因组序列差异，而参考基因组与待测样本之间的差异会严重...
基因组系统解析工具开发研究取得重要进展（图）
解析工具 非模式 海洋生物
2024/4/16
近日，中国工程院院士、南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）教授包振民团队开发国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具（PanSyn，https://github.com/yhw320/PanSyn）。相关成果发表于《自然-实验手册》。该成果是包振民团队长期积累的丰富基因组学分析方法和工具研发经验的系统总结和提升。
2024年4月2日，华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室周道绣课题组在Genome biology上发表了题为“DNA methylation remodeling and the functional implication during male gametogenesis in rice”的研究论文。研究结果表明，水稻DNA甲基化在雄配子发生过程中存在动态重编程现象，直接影...
中国科学院北京基因组所揭示共转录m6A修饰建立机制及功能（图）
基因 分子细胞 核酸结
2024/4/7
2024年4月2日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）任捷团队和杨运桂团队，在《分子细胞》（Molecular Cell）上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription termination and genome stability的研究论文。该研究揭示了三...
北京基因组所（国家生物信息中心）揭示共转录m6A修饰建立机制及其功能（图）
核酸结构 细胞分化
2024/4/22
2024年4月2日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）任捷团队和杨运桂团队合作在Molecular Cell在线发表了题为“DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription termination and genome stability”的研究论文，揭示了三链核酸结构R-lo...
北京基因组所（国家生物信息中心）合作创建中国人复合DNA甲基化时钟（图）
复合DNA甲基化 遗传
2024/4/22
2024年3月29日，来自中国衰老标志物研究联合体（ABC）的多个课题组密切合作，在Protein & Cell 期刊发表了题为 “DNA methylation clocks for estimating biological age in Chinese cohorts” 的研究论文。这项研究基于中国南北方两个独立的人群队列，系统解析了中国人群在衰老过程中基因组DNA甲基化图谱的变...
北京基因组所（国家生物信息中心）合作解析人脐血及多能干细胞来源红细胞终末分化体系（图）
解析 细胞 临床
2024/4/22
功能性红细胞的体外再生是缓解临床用血需求的重要途径之一。多能干细胞 （Pluripotent Stem Cells, PSC）因其具有无限扩增的潜能，理论上是生成红细胞（Red Blood Cells）的最理想来源。但是，PSC来源的红细胞脱核率极低，成人型血红蛋白表达严重不足，导致该技术体系获得的红细胞数量很少。同样具有多谱系分化潜能的特征，人脐带血单个核细胞（UCBMN）也是体外红细胞再生主要...
科学家首次发布银鲳高质量染色体水平参考基因组（图）
银鲳 染色体 人工繁育
2024/4/16
近日，中国科学院海洋研究所在银鲳基因组学研究方面取得新进展，首次发布了我国重要名贵经济鱼类——银鲳的高质量染色体水平参考基因组，相关研究成果在《自然》子刊《科学数据》在线发表。
红细胞生成是一个复杂、动态、受严格调控的生物学过程，该过程可产生人体所有的成熟红细胞。红细胞来源于造血干祖细胞(HSPCs)，并依次经历爆式红系集落形成单位(BFU-E)、红系集落形成单位(CFU-E)、成红细胞前体(pro-E)、嗜碱性成红细胞(Baso-E)、多染性成红细胞(Poly-E)、正染性成红细胞(ortho-E)等阶段逐渐分化成熟，脱核后成为网织红细胞（reticulocyte）。能...
北京基因组所（国家生物信息中心）合作开发射血分数保留型心力衰竭早期风险预测模型（图）
风险预测 临床 评估
2024/4/22
2024年3月22日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）与解放军总医院第六医学中心合作开发的射血分数保留型心力衰竭早期风险预测模型HFmeRisk正式获得专利授权，专利名称为“一种用于预测射血分数保留型心衰风险的模型”（CN105586406A），发明人为中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）方向东研究员、博士研究生赵学彤（已毕业，现任国家生物信息中心工程师）、渠鸿竹副研究员、...
内分泌系统是人体内复杂而重要的协调控制系统，它利用激素作为传递信息的“信使”，在机体各项生命活动中发挥着不可或缺的作用。肾上腺是内分泌系统的重要组成器官，虽体积小，却扮演着远程调控和紧急响应部署的重要角色，在调节压力、维持血压、控制心率以及调控代谢、免疫和生殖等方面具有关键作用。随着年龄的增长，肾上腺的功能逐渐衰退，激素分泌发生紊乱，这些变化可引起应激反应受损、免疫功能下降、全身性炎症增加，并影响...
《番茄基因组设计育种》获优秀图书一等奖（图）
《番茄基因组设计育种》 优秀图书 一等奖
2024/4/8
近日，由西北农林科技大学园艺学院番茄专家梁燕教授翻译出版的《番茄基因组设计育种》荣获中国农业出版社2023年度优秀图书一等奖。
北京基因组所（国家生物信息中心）合作解析sirtuin蛋白调控衰老的表观遗传基础（图）
解析 蛋白调控 遗传
2024/4/22
Sirtuin蛋白是一类从古细菌到人类高度保守的去乙酰化酶，其酶活依赖于辅酶因子β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸NAD+，是通过热量限制延缓衰老策略的重要靶点，在多个物种中发挥着寿命调控相关的功能，被称为“长寿蛋白家族”。人类sirtuin家族包括7个成员（SIRT1-7），均具有NAD+结合和相对保守的催化结构域，然而在细胞中的定位和活力却不尽相同。由于研究手段的限制，目前尚缺乏针对人类SIRT1-7生...