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中国科学院武汉植物园在小粒咖啡种质资源全基因组重测序解析研究上取得进展（图）
小粒咖啡 种质资源 基因
2022/10/27
小粒咖啡（Coffea arabica）隶属于茜草科（Rubiaceae），是一种多年生的重要经济作物。随着全球对特色咖啡需求的显著增加，开发市场需求高的咖啡品种是必不可少的，埃塞俄比亚作为小粒咖啡基因库的主要来源，其种质资源具有很高的价值，可用于培养优良性状的品种。基因组重测序可以促进分子育种，且通过重测序分析产生的标记有助于推进传统作物育种方法，进而缩短开发新品种所需的时间。因此在咖啡中开发和...
近日，吉林省农业科学院郝东云团队联合中国农业大学王向峰团队在《基因组蛋白质组与生物信息学报》（GPB）在线发表研究论文，对250份大豆种质材料进行了深度全基因组重测序和生物信息学分析，构建了大豆性状耦合的遗传关联网络。
旨在利用重测序技术分析狮头鹅基因Indel差异并探讨其产蛋调控通路。本研究选用产蛋量有差异的成年狮头鹅和吉林白鹅母鹅各5只，采用全基因组重测序方法，对两个品种基因组水平的插入缺失突变情况进行比较分析。结果表明，测序共得到350.35 Gb数据，其中Q20与Q30平均值分别为96.74%、92.19%；通过注释分析发现了748 821.2个Indel变异位点。10只试验鹅的Indel位点在编码区（C...
为揭示毛竹重要变型的全基因组突变类型，选取4个有代表性的毛竹变型，采用高通量重测序技术，进行全基因组重测序，测序深度12×。分别提取毛竹4个变型与参考基因组间发生非同义突变的SNP、CDS区发生InDel与SV的基因，比较可以发现，2个秆形变异的竹种圣音竹和厚壁毛竹基因组的变异基因数目和变异类型相近，而2个秆色变异的竹种黄槽毛竹和黄皮花毛竹基因组的变异数目和变异类型相近。4个毛竹变型均存在多个基因...
2019年7月12日，西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室在基因组学领域国际知名期刊Genome Biology上发表了题为“Frequent intra- and inter-species introgression shape the landscape of genetic variation in bread wheat”的论文，揭示了六倍体小麦遗传多样性来源于频繁的与野生小...
由Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa)引起的猕猴桃细菌性溃疡病是为害猕猴桃的一种毁灭性病害,1996年被列为我国森林植物检疫对象。本研究对来源于我国7个受溃疡病为害最严重地区的21个Psa菌株进行重测序分析,通过主成分分析和系统发育学分析将21个菌株分为三大类群;固定系数分析结果显示所有群体的FST值均小于0.05;核苷酸多态性分析结果显示所有菌株的Θ...
世界首个梅花全基因组重测序研究完成（图）
梅花 全基因组 重测序研究
2018/5/31
2018年4月27日，张启翔教授领衔的国家花卉工程技术研究中心，与青岛华大基因研究院、深圳华大生命科学研究院以及宾夕法尼亚州立大学等单位通力合作完成了首个梅花全基因组重测序研究，构建完成了世界首张梅花全基因组变异图谱，“梅花花部性状的遗传结构”（The genetic architecture of floral traits in the woody plant Prunus mume）研究论文...
内蒙古农业大学动物科学学院师生共同完成的科研论文“大规模全基因组重测序检测绒山羊的选择信号”发表于《Scientific Reports》（图）
内蒙古农业大学动物科学学院 科研论文 大规模 全基因组 绒山羊 Scientific Reports
2017/12/11
近日，由我校动物科学学院博士研究生李晓凯，教师苏蕊为共同第一作者，李金泉教授为通讯作者完成的科研论文《Identification of selection signals by large-scale whole-genome resequencing of cashmere goats》（《大规模全基因组重测序检测绒山羊的选择信号》），在Nature（《自然》）旗下的《Scientific R...
桃全基因组重测序揭示桃进化历史及人类活动对果树的影响（图）
桃全基因组重测序 桃进化历史 人类活动 果树
2014/8/8
近日，中国农业科学院郑州果树研究所王力荣研究团队与深圳华大基因联合开展的桃全基因组重测序工作取得阶段性进展。该研究对84份桃种质进行重测序，在全基因组水平上绘制了从光核桃到普通桃的进化路线，并鉴定了与人工选择相关的候选基因。相关研究结果在线发表于《基因组生物学》（Genome Biology）。
我国完成31个大豆基因组重测序
31个 大豆基因组重 测序
2010/11/16
由香港中文大学、华大基因研究院、农业部、中国科学院等单位合作的“大豆回家”项目研究成果，“31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和进化选择模式”2010年11月14日在国际著名杂志《自然—遗传学》上在线发表。
《科学》：我国完成桑蚕大规模基因组重测序
桑蚕 基因组重测序
2009/8/31
北京时间2009年8月28日凌晨2时，由深圳华大基因研究院与西南大学合作的研究成果“40个基因组的重测序揭示了蚕的驯化事件及驯化相关基因”在国际权威学术刊物《科学》上发表，这是科学家继2003年在家蚕基因组研究领域取得进展后的又一重要成果。该研究由中国工程院院士、著名蚕学家向仲怀教授带领完成；西南大学教授、中国家蚕基因组主要攻关专家夏庆友为论文第一作者。