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中国科学院科学家描绘小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱（图）
图谱 遗传学 细胞
2024/4/19
2024年4月16日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心惠利健团队联合杭州华大生命科学研究院研究人员，在《自然-遗传学》（Nature Genetics）上发表了题为A spatiotemporal atlas of cholestatic injury and repair in mice的研究成果。该研究以细胞水平的空间分辨率描绘了胆汁淤积与再生过程中的损伤响应和微环境信号的时空动态变化特征，...
2024年4月16日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）惠利健研究组联合杭州华大生命科学研究院在国际学术期刊Nature Genetics发表了最新研究成果：“A spatiotemporal atlas of cholestatic injury and repair in mice”。该研究以细胞水平的空间分辨率描绘了胆汁淤积与再生过程中的损伤响应和微环境信号的时...
近日，中国农业大学宋任涛教授团队在国际知名期刊Nature Communications《自然·通讯》上在线发表了题为“Decoding the gene regulatory network of endosperm differentiation in maize”的研究成果。这标志着首次在作物胚乳中实现了单细胞分辨率的转录组和基因调控网络解析，为作物产量和品质育种提供了重要的研究资源。
科学家揭示小鼠胚胎器官形成初期的时空转录图谱
小鼠胚胎 器官形成初期 时空转录图谱
2024/1/16
胚胎正常发育需要基因表达的时空调控。单细胞技术的发展使研究早期胚胎调控具有更高的分辨率，如对小鼠胚胎发育过程中多数细胞状态的详细分子定义。德国马克斯·普朗克分子遗传学研究所等机构揭示小鼠胚胎器官形成初期的时空转录图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Spatiotemporal transcriptomic maps of whole mouse embryo...
近日，福建农林大学园艺学院/园艺植物生物工程研究所赖钟雄研究员/林玉玲教授团队在The Plant Journal（中科院一区TOP期刊，IF=7.091）在线发表了题为“Single-cell RNA sequencing analysis of the embryogenic callus clarifies the spatiotemporal developmental trajector...
我国科学家构建非洲猪瘟病毒感染的全景式细胞转录图谱
非洲猪瘟病毒 全景式细胞转录图谱 病原体
2022/6/15
非洲猪瘟病毒（ASFV）是非洲猪瘟的病原体，它具有高度传染性和致命性，严重危害全球养猪业。然而，目前尚无针对ASFV的商用疫苗和抗病毒药物，ASFV感染的发病机制亦不明确。近期我国科学家构建了ASFV感染的全景式细胞转录图谱，揭示了病毒在宿主细胞内复制的调控模式。研究成果发表在《美国科学院院刊》（PNAS），标题为“Transcriptome profiling in swine macropha...
中国科学院微生物所合作构建非洲猪瘟病毒感染的全景式细胞转录图谱（图）
非洲猪瘟 病毒感染 细胞转录图谱
2023/7/4
2022年5月5日，中国科学院微生物研究所高福院士团队、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所仇华吉研究员团队、北京大学汤富酬教授团队合作，在PNAS上在线发表了题为 Transcriptome Profiling in Swine Macrophages Infectedwith African Swine Fever Virus at Single-Cell Resolution 的研究论文。该研究首...
2022年5月5日，中国科学院微生物研究所高福院士团队、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所仇华吉研究员团队、北京大学汤富酬教授团队合作，在PNAS上在线发表了题为 Transcriptome Profiling in Swine Macrophages Infectedwith African Swine Fever Virus at Single-Cell Resolution 的研究论文。该研究首...
SARS-CoV-2是人类呼吸道冠状病毒之一，具有高度传播性，其感染会引发机体天然免疫反应，导致肺炎和急性呼吸窘迫综合征。然而，越来越多的COVID-19患者表现出肝脏、心脏、肾脏、血管系统，甚至是神经系统的损伤和严重的康复后遗症，系统研究SARS-CoV-2感染后机体各器官的全转录组变化对于认识宿主免疫应答机制十分必要。
斑马鱼全脑转录图谱揭示神经元表型分子调控规则（图）
中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心 斑马鱼 全脑转录图谱 神经元
2021/12/16
2021年12月13日，eLife在线发表题为The landscape of regulatory genes in brain-wide neuronal phenotypes of a vertebrate brain的研究论文，该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中心研究员何杰研究组、严军研究组和杜久林研究组共同完成...
随着高通量测序技术的不断发展，转录组测序（RNA-seq）已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法，并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生，以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临巨大挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息，服务生物医学基础研究领域需求，构建标准化数据分析流程和结构化元信息审编模型，建立面向多物种基因转录特征的数据集成与管理资源十分必...
科学家绘制水稻幼苗根叶单细胞转录图谱（图）
科学家 绘制水稻幼苗 根叶单细胞 转录图谱
2021/6/28
中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究组应用单细胞转录组测序技术，获得了水稻幼苗叶和根超过20万个单细胞的转录组信息，利用细胞类型标记基因和原位杂交技术，对每个细胞的身份进行了鉴定，构建了水稻幼苗叶和根的单细胞转录图谱。相关结果近日发表于《遗传学和基因组学期刊》。
中国科学院昆明动物研究所等解析人类大脑纺锤形神经元的转录图谱
中国科学院昆明动物研究所 人类大脑 纺锤形 神经元 转录图谱
2018/12/11
中国科学院昆明动物研究所宿兵研究组与中南民族大学中国人类脑库中心开展合作，利用激光显微切割和微量样本RNA测序技术解析了来源于人脑前扣带回纺锤形神经元的转录图谱，发现了300多个纺锤形神经元特异表达升高或降低的基因，鉴定了4个新的纺锤形神经元标记基因。对转录组数据的进一步分析发现，这些基因与纺锤形神经元的形态发育（如树突分支和髓鞘化等）和功能（如人类社会情感类疾病等）都密切相关。人类纺锤形神经元转...