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2024年3月29日，国际学术期刊Developmental Cell在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）周波研究组和邹卫国研究组的合作研究成果：“Fibrous periosteum repairs bone fracture and maintains the healed bone throughout mouse adulthood”。该项工作揭示了小...
单细胞代谢组分析有了新技术
单细胞代谢组 新技术 肿瘤细胞
2024/3/1
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员许国旺、副研究员胡春秀和副研究员石先哲等在单细胞代谢组分析新技术研究中取得新进展，研发了同轴纳升电喷雾电离-大气压化学电离复合电离源（concentric nanoESI-APCI hybrid source），提高了细胞中低丰度、低电离效率和弱极性代谢物的检测能力，实现了单细胞代谢组的高覆盖、高灵敏分析。相关成果发表于《先进科学》。
2024年2月26日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高分辨分离分析及代谢组学研究组（1808组）许国旺研究员、胡春秀副研究员和石先哲副研究员等在单细胞代谢组分析新技术研究中取得新进展，研发了同轴纳升电喷雾电离-大气压化学电离复合电离源（concentric nanoESI-APCI hybrid source），提高了细胞中低丰度、低电离效率和弱极性代谢物的检测能力，实现了单细...
中国科学院科学家研发出单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法（图）
细胞 空间 学习算法
2024/2/22
环形RNA是一类广泛表达的非编码RNA，有较高的细胞类型及组织表达特异性，在器官发育及肿瘤发生等过程中起着重要调控作用。环形RNA由3‘端的受体位点和5’端的供体位点共价连接形成，这一过程被称为反向剪接，然而由于缺少poly(A)尾，环形RNA无法被经过polyA富集等转录组建库方式有效捕获。因此，环形RNA的表达信息在绝大部分单细胞以及空间转录组数据中缺失。为了获得丰富的单细胞及空间水平的环形R...
我国科学家自主研发，单细胞多组学整合技术有了新突破（图）
单细胞多组学 单细胞测序技术 马赛克
2024/1/26
近日，军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。
2024年1月2日，国际学术期刊Cell Metabolism在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心周波研究组、华东师范大学万晶晶教授和上海交通大学钱昆教授的合作研究成果：“Deciphering the metabolic heterogeneity of hematopoietic stem cells with single-cell resolution”。该工作从头搭建了一套结合抗...
近日，中国农业大学宋任涛教授团队在国际知名期刊Nature Communications《自然·通讯》上在线发表了题为“Decoding the gene regulatory network of endosperm differentiation in maize”的研究成果。这标志着首次在作物胚乳中实现了单细胞分辨率的转录组和基因调控网络解析，为作物产量和品质育种提供了重要的研究资源。
科学家建立首个人类肢体发育的单细胞时空图谱（图）
单细胞 科学家 肢体发育
2023/12/18
中山大学中山医学院教授张宏波团队与英国Sanger 研究所教授Sarah Teichmann团队合作，研究建立了首个人类肢体发育的单细胞时空图谱并解析关键调控机制。12月6日，相关成果在线发表于Nature。
中国科学院广州地化所发展出单细胞SIP-反向基因组学技术（图）
单细胞 基因 生物地球化学 有机污染
2023/11/21
微生物是地球上丰富且分布广泛的生命形式，在生态系统中对有机物的生物地球化学循环发挥着关键作用。微生物降解是有机污染物分解过程中的重要环节。其中，降解功能微生物可将污染物转化为无毒化合物，是有机污染物降解的执行者。因此，研究原位降解功能微生物的种类和代谢特性，并从复杂环境微生物群落中发掘具有“特定代谢功能”的活体菌株资源，以提升有机污染物去除效率，是业界长期追求的目标，亦是环境微生物研究的焦点和难点...
了解纳米药物的细胞内行为和受纳米材料-生物相互作用影响的亚细胞结构的形态变化，是研究纳米药物的生物活性和安全性评价的重要内容。解析纳米药物-细胞互作的基本原理和机制，对于准确把握纳米药物的生物学效应具有重要意义，为高效低毒纳米药物的精确设计和临床转化提供指导和支持。生物微环境和细胞结构的复杂性及胞内纳米药物化学形态的动态变化等为纳米尺度下单细胞的原位无标记分析带来了挑战。
广州地化所：发展了单细胞SIP-反向基因组学技术定向识别-分离-培养功能微生物（图）
细胞 基因 定向识别 分离
2024/1/10
微生物是地球上最为丰富且分布最为广泛的生命形式，在生态系统中对有机物的生物地球化学循环发挥着关键作用。微生物降解是有机污染物分解过程中至关重要的环节，其中，降解功能微生物可将污染物转化为无毒化合物，是有机污染物降解的执行者。因此，深入研究原位降解功能微生物的种类和代谢特性，并从复杂环境微生物群落中发掘具有“特定代谢功能”的活体菌株资源，以提升有机污染物去除效率，是业界长期追求的目标，亦是环境微生物...
2023年11月14日下午，中国科学院上海营养与健康研究所所级科学数据中心举办了“单细胞转录组数据基础分析流程快速入门”培训，旨在帮助科研人员快速掌握相关技术和工具，使其具备基本的生物信息分析能力。本次培训由所级科学数据中心工程师黄俞玮担任主讲人，她在单细胞转录组数据分析方面拥有丰富的实践经验和专业知识。
中国科学院单细胞纳米药物及亚细胞结构的无标记原位同步辐射成像方法学研究获进展（图）
单细胞 纳米药物 辐射成像
2023/11/16
2023年11月13日，中国科学院国家纳米科学中心陈春英团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为In situ label-free X-ray imaging for visualizing the localization of nanomedicines and subcellular architecture in intact single cells的...
美国绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱
美国 小鼠全脑 单细胞 空间转录组图谱
2024/1/15
美国麻省理工学院和布罗德研究所的科研人员绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱，为深入理解大脑结构与功能提供了重要基础。该团队基于109万个高质量空间分辨单细胞基因表达定义出小鼠大脑更精细的组织区域，绘制出的大规模分子空间图谱囊括了超100万个细胞及其基因表达特征、空间坐标、分子细胞类型、分子组织区域类型，以及遗传操作可及性。相关研究成果发表于《Nature》期刊。
中国科学院研究实现大规模单细胞信号记录和脑机接口运动控制（图）
细胞信号 神经界面 柔性
2023/11/6
2023年10月23日，《科学进展》（Advanced Science）在线发表了题为An Ultraflexible Electrode Array for Large-Scale Chronic Recording in the Nonhuman Primate Brain的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心赵郑拓研究组与临港实验室李澄宇研究组合作完成。该研究...