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中国科学院生物物理研究所专利：EF4蛋白编码基因沉默在癌症治疗方面的应用
粉霉病是一种严重影响甜瓜果实品质并造成经济损失的采后病害,效应蛋白在病原真菌致病机制中发挥着重要作用。为获得引起甜瓜粉霉病病原菌粉红单端孢(Trichothecium roseum)的效应蛋白,本研究利用一系列生物信息分析软件(SignalP, TMHMM, Protcomp, big-PI Predictor, TargetP和Blastp)对该菌进行效应蛋白预测与分析,并采用实时荧光定量PCR...
北京大学系统生物医学研究所尹玉新课题组最近取得研究突破，揭示了真核生物中新的蛋白编码机制，并由此发现PTEN家族的新蛋白PTENα，进一步证实其定位于线粒体、参与调控细胞能量代谢过程。该研究成果于2014年5月6日以封面文章形式发表于Cell子刊Cell Metabolism（IF14.6），论文题目为“PTENα, a PTEN isoform Translated through Altern...
男性不育常伴随精子数量减少。Pygo2基因在染色质重塑的伸长精细胞中表达, 其功能受损会导致精子形成阻滞和精子生成减少而引发不育。文章旨在检测引起人特发性少精子症和无精子症的Pygo2基因突变。从77例正常生育力男性和195例特发性少精子症和无精子症患者静脉血提取DNA, 采用聚合酶链式反应-测序方法对Pygo2基因3个蛋白质编码区进行测序对比, 非同义单核苷酸多态性(Single nucleot...
2型猪链球菌菌毛蛋白编码基因SSU0474生物学特性分析
2型猪链球菌 菌毛蛋白 SSU0474基因敲除 生物学特性
2014/7/23
构建2型猪链球菌中国强毒株05ZYH33菌毛蛋白编码基因SSU0474缺失突变株,并对其生物学特性进行分析。方法 利用同源重组原理构建SSU0474缺失突变株,PCR及RT-PCR对筛选的突变株进行验证,革兰染色和电镜比较突变株SSU0474与野毒株之间的差异,小鼠实验进一步比较突变株的毒力变化。结果 引物特异性PCR证实SSU0474基因缺失突变株构建成功;革兰染色结果显示突变株和野毒株染色特性...
霍乱弧菌04-5a糖发酵激活蛋白编码基因分析
霍乱弧菌 糖发酵激活蛋白 基因测序
2014/8/5
比较霍乱弧菌04-5a株糖发酵激活蛋白编码基因与霍乱流行株与非流行株相关序列的差异,明确其基因型.方法 采用基因克隆测序方法,对霍乱弧菌04-5a株糖发酵激活蛋白编码基因进行序列分析,并与相关序列进行比较.结果 霍乱弧菌04-5a株糖发酵激活蛋白编码基因由771个碱基对组成,编码258个氨基酸的多肽,流行株和非流行株相关序列比较发现,04-5a株与流行株两者基因完全相同,与非流行株在334、622...
临床分离鸡毒支原体粘附素蛋白编码基因pvpA的分子特征
鸡毒支原体 pvpA基因 粘附蛋白 变异
2009/12/3
【目的】探讨中国临床分离鸡毒支原体粘附素蛋白（PvpA）编码基因pvpA的分子特征，为进一步了解鸡毒支原体致病机制、建立新的鉴别诊断方法奠定基础。【方法】利用巢式PCR法对41株广东、四川和北京地区临床分离的鸡毒支原体和3株参考株的pvpA基因进行扩增并测序，分析中国临床分离株pvpA的基因变异特征。【结果】所有临床分离株pvpA基因分子特征与强毒株S6，BG44T一致，与疫苗株F36完全不同。临...
甘蓝中硫氧还蛋白编码基因THL1的分子特性及表达研究
甘蓝 类硫氧还蛋白 基因克隆 序列分析
2009/8/6
采用PCR和RT2PCR技术, 以‘E1’甘蓝基因组DNA和柱头cDNA为模板对THL1基因进行扩增克隆, 得到的片段长度分别为732 bp和455 bp。序列分析表明, 克隆的DNA和cDNA序列与甘蓝‘西园四号’THL1的DNA和cDNA同源性分别为97.9%和98.3%, 两条序列内含子的大小不同; 同时, 前者第2内含子不符合典型的GT2AG规则: 即第2个内含子3′端碱基为AT。将THL...
水稻一个C3HC4型锌指蛋白编码基因的克隆表达与分析
水稻 锌指蛋白 基因克隆 表达
2009/8/3
锌指蛋白是生物体内数量最多的转录调控因子，它在动植物的生长发育中都起着十分重要的作用。通过RT-RCR从水稻cDNA文库中获得一个水稻锌指蛋白基因OsZNP的完整阅读框，序列分析表明该基因编码一条253个氨基酸残基的多肽，含有一个典型的C3HC4型锌指结构。将测序正确的OsZNP基因克隆到表达载体pGEX-KG中，转化宿主菌BL21(DE3)，成功地构建了原核表达载体pGEX-KG-OsZNP。经...
酵母双杂交技术筛选Hcbp6结合的肝细胞蛋白编码基因
酵母双杂交技术 筛选 Hcbp6结合 肝细胞蛋白编码基因
2009/7/22
目的:Hcbp6是与核心蛋白相结合的未知功能蛋白基因，为了初步提示他的生物学功能和在细胞中的存在形式，采用酵母双杂交体系寻找与他相互作用的肝细胞蛋白，探讨Hcbp6的生物功能.方法:应用酵母双杂交系统3，构建Hcbp6诱饵质粒并转化酵母AH109，与含人肝细胞cDNA文库质粒的酵母Y187进行配合，在涂有x-alpha-gal营养缺陷型培养基(SD/-Trp-Leu-His-Ade)上筛选生长．挑...
非蛋白编码小RNA分子在癌症中的作用
miRNA 癌症 肿瘤抑制基因 致癌基因
2009/7/21
microRNA（miRNA）是一类含量丰富的非蛋白编码（non-protein-coding）小RNA，可作为负性基因调节器，能调节多种生物进程。生物信息数据显示，每个miRNA能控制数百种基因靶标，miRNA可能对每一条遗传通路都有影响。miRNA突变或误表达与多种人体癌症有关，同时也表明miRNA可以作为肿瘤抑制基因和致癌基因。已证明miRNA能抑制重要癌症相关基因的表达，因此miRNA可能...
水稻一个C3HC4型锌指蛋白编码基因的克隆表达与分析
水稻 锌指蛋白 基因克隆 表达
2009/7/20
锌指蛋白是生物体内数量最多的转录调控因子，它在动植物的生长发育中都起着十分重要的作用。通过RT-RCR从水稻cDNA文库中获得一个水稻锌指蛋白基因OsZNP的完整阅读框，序列分析表明该基因编码一条253个氨基酸残基的多肽，含有一个典型的C3HC4型锌指结构。将测序正确的OsZNP基因克隆到表达载体pGEX-KG中，转化宿主菌BL21(DE3)，成功地构建了原核表达载体pGEX-KG-OsZNP。经...
鲈形目线粒体DNA蛋白编码基因的适用性分析
鲈形目 线粒体DNA 蛋白编码基因 系统进化
2009/7/15
［目的］ 对线粒体DNA 13种蛋白质编码基因的系统进化分析能力进行了评估。［方法］ 单个基因和基因拼接序列比较，综合考虑序列的信息量和邻位连接法构建系统进化树的置信度。［结果］ 按分类阶元不同将基因都分成不同的4等。在鲈形目的科间阶元，最好的为〖STBX〗ND6和cox2；好的序列为ND5和ND4；ND4L、ND3和ATP8差；包括Cyt b、cox1在内的其余〖STBZ〗6种基因为中等...
基于线粒体DNA全序列11个蛋白编码基因拼接序列的鳞翅目昆虫系统发育研究
鳞翅目 系统发育 线粒体DNA全序列
2010/3/29
目前已测定线粒体DNA全序列的鳞翅目昆虫有12种。由于高变异性和强核苷酸组成偏好性，去除了两个蛋白基因和两个物种，最终以10个鳞翅目物种的11个蛋白编码基因拼接序列对鳞翅目分子系统发育关系进行了研究。与前人的结果一致，基于11个蛋白编码基因拼接序列数据所构的最大似然树支持鳞翅目，鳞翅目内各总科和各科均为单系群。与MINET［1］基于形态学数据的结果相同，各总科的系统发育关系为{卷蛾总科＋［螟...