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iBond数据库是由清华大学程津培院士领衔创建的全球最权威的键能数据库，其收集了文献报道的两万余种化合物的约三万五千个准确pKa数据。研究团队对iBond数据库中已有数据进行了系统整理标记，形成了种类丰富、溶剂分布广泛、数据分布合理的数据集。在自此基础上，团队引入了结合化合物结构特征和物理化学性质的SPOC描述符对化合物进行精确描述，并采用当前流行的XGBoost和神经网络算法构建了高精度预测模型...
为明确灰葡萄孢BcPDR1基因与病菌cAMP信号途径中PKA编码基因BcPKA1、BcPKA2、BcPKAR之间的关系,利用Real-time PCR技术分析了BcPDR1基因突变对PKA编码基因BcPKA1、BcPKA2、BcPKAR表达的影响,以及PKA编码基因突变对BcPDR1基因表达的影响。结果发现,BcPDR1基因突变体中BcPKA1、BcPKA2、BcPKAR的表达水平均显著高于野生型...
清华大学化学系|精准pKa测定揭示有机盐在弱极性离子液中可完全解离（图）
离子液 阴阳离子 pKa 溶剂
2021/8/5
离子液体全部由阴阳离子组成，具有低蒸气压和通常分子溶剂所不具有的许多独特性质，近2016年来得到极广泛的应用，有望成为替代高挥发性有机溶剂的新一类基本介质。但相对于离子液中合成与应用的迅猛发展，对其特有的溶剂化作用的基础研究严重滞后。基础分子科学中心程津培院士课题组近2016年来致力于离子液中各类化学键能标准序列的建立，以期为离子液中的化学转化提供坚实的理性分析基础。
药物早期评价中解离常数pKa测定的研究获进展（图）
药物 解离常数pKa 酸性化合物
2014/8/13
弱酸性或弱碱性化合物通常以离子形式和中性形式存在。未解离的中性化合物亲脂性和膜渗透性强，离子化形式则水溶性更好。通常采用解离常数pKa反映离子化合物在溶液中的解离程度。化合物的解离程度直接影响其亲脂性、溶解性等，进一步则影响药物的吸收、分布、代谢、排泄(ADME)性质。因此作为药物早期成药性评价中很重要的性质之一，pKa值的测定是很有必要的。此外，获知化合物的pKa值可以为酸碱化合物的盐形筛选、纯...
药物早期评价中解离常数pKa测定的研究进展（图）
药物 早期评价 解离常数pKa
2014/8/29
弱酸性或弱碱性化合物通常以离子形式和中性形式存在。未解离的中性化合物亲脂性和膜渗透性强，离子化形式则水溶性更好。通常采用解离常数pKa反映离子化合物在溶液中的解离程度。化合物的解离程度直接影响其亲脂性、溶解性等，进一步则影响药物的吸收、分布、代谢、排泄(ADME)性质。因此作为药物早期成药性评价中很重要的性质之一，pKa值的测定可为值是很必要的。此外，获知化合物的pKa值可以为酸碱化合物的盐形筛选...
胰升糖素样肽1通过PKA途径促进3T3-L1脂肪细胞内脂素的表达
胰升糖素样肽1 内脂素 脂肪细胞 糖尿病
2014/4/9
检测胰升糖素样肽1(GLP-1)是否调节内脂素的合成,并探讨其作用机制。方法以3T3-L1分化成熟脂肪细胞为模型,GLP-1干预后,提取总RNA定量检测内脂素转录水平,收集培养液酶联免疫法检测内脂素分泌水平;PKA通路抑制剂H89预处理30 min,检测内脂素的转录水平。结果GLP-1呈剂量依赖性增加3T3-L1细胞表达内脂素,10-10mol/L时显著提高(P<0.05), 10-9mo...
观察2型糖尿病大鼠在诱发反复重度低血糖时海马组织中蛋白激酶A(PKA)、蛋白激酶C(PKC)、钙调素依赖蛋白激酶Ⅱ(CaMKⅡ)磷酸化信号通路相关蛋白水平变化，探讨其在认知功能损害中的作用。方法 将大鼠随机分为4组：对照组、糖尿病组、反复重度低血糖组和糖尿病反复重度低血糖组。采用链脲佐菌素(STZ)建立2型糖尿病大鼠模型；对照组、糖尿病组给予生理盐水，反复重度低血糖组和糖尿病反复重度低血糖组给予普...
盘基网柄菌粘附分子gp150的定位及其与PKA活性关系的研究
荧光定位 gp150 蛋白激酶A HPLC
2014/1/10
细胞粘附分子gp150在盘基网柄菌细胞发育后期起着重要作用.用gp150抗体定位gp150在细胞发育重要阶段的分布，显示在细胞发育的不同时段，gp150的定位有着明显的区别.在聚集前的细胞流时期，gp150还均匀分布在细胞质内，到了细胞丘时期，gp150就移至多细胞聚集体的边缘部位.到了蛞蝓体时期，gp150在前柄细胞的表达量明显大于前孢子细胞，提示了gp150对柄细胞的作用.而当细胞发育至子实体...
目的观察高糖环境下THP-1细胞葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PD）活性及呼吸爆发功能改变及其可能信号通路。方法利用蛋白激酶A（PKA）特异性抑制剂PKI和PKA激动剂Forskolin 预处理不同浓度葡萄糖培养的THP-1 细胞，检测不同处理组的G6PD活性、腺苷酸环化酶(cAMP)含量、ROS产量及磷酸化p47phox的表达变化。结果与正常对照组相比，高糖组及PKA激动组的G6PD活性、ROS产...
Playing Around with “Kaleidagraph” Program for Determination of pKa Values of Mono, Di and Tri Basic Acids in a Physical-Organic Chemistry Laboratory
pKa Kaleidagraph Acid-Base Equilibriums
2013/2/19
A simple and easy laboratory protocol for the determination of the pKa of mono, di and tri-basic weak acids is described in this paper by using arbitrarily simulated data as a function of pH. An equat...
PKC、PKA信号通路在调控体外培养人牙囊细胞VEGF表达中的作用
牙囊细胞 血管内皮生长因子 蛋白激酶C 蛋白激酶A
2012/7/16
该文主要探讨PKC、PKA信号通路在调控体外培养人牙囊细胞VEGF表达中的作用。选取生长状态良好的第4代人牙囊细胞， 采用Real-time PCR和Western blot分别检测PKC激动剂(PMA)、PKC非特异性抑制剂(Gö6983)、PKC-α和γ特异性抑制剂(HBDDE)、PKC-β特异性抑制剂(LY333531)、PKA激动剂(dbcAMP)和抑制剂(KT5720)对体外培...
探讨cAMP-PKA信号通路对细胞色素P4503A（CYP3A）在正常肝细胞L02表达中的作用。方法 L02细胞中分别加入8-溴-环腺苷酸(8-Br-cAMP)10 μmol·L-1及抑制剂H-89 10 μmol·L-1, 培养48 h, 分别采用完整细胞免疫组化法、Western印迹法和红霉素-N-脱甲基法检测细胞中PKA、孕烷X受体（PXR）及CYP3A的表达。结果 与正常对照组PKA蛋白表...
小鼠截短型CDC25B蛋白PKA体外磷酸化分析
小鼠 CDC25B PKA 体外磷酸化
2014/8/4
通过体外磷酸化研究和放射自显影技术证实小鼠CDC25B蛋白是蛋白激酶A(PKA)的直接作用底物。方法 构建小鼠截短型pGEX-4T-2-CDC25B201原核表达载体,异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达,glutathione Sepharose 4B亲和层析纯化CDC25B蛋白,与PKA进行体外磷酸化反应,分别采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)、蛋白免疫印迹...
可溶性纤维连接蛋白对SGC-7901细胞中PKA活性的影响
可溶性纤维连接蛋白 PKA p-VASP Ht31
2012/7/18
本研究通过向SGC-7901细胞中加入可溶性纤维连接蛋白(fibronectin， FN)探讨可溶性纤维连接蛋白对PKA活性的影响。实验采用蛋白印迹技术检测可溶性FN在不同浓度及作用时间情况下对PKA Ca亚基表达水平以及PKA作用底物血管扩张刺激磷蛋白(vasodilator-stimulated phosphoprotein，VASP)磷酸化水平的影响; 采用免疫荧光技术检测可溶性FN对PKA...
Determination of the pKa Value of Phenolphthalein by Means of Absorbance Measurements
Medical Science Teaching
2013/2/21
We here report a laboratory protocol for the determination of the pKa value of an acid by means of determinations obtained with a spectrophotometer. Students determine the acidity constant (Ka) and th...