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Cloning and sequencing of the complicated rDNA gene family of Bos taurus
GC-rich repetitive sequences PCR rDNA rRNA Bos Taurus
2015/6/2
The rDNA genes coding for ribosomal RNA (rRNA) in animals are repeat sequences with high GC content and complicated structure. Based on the sequences of human ribosomal DNA repeat unit and transcripti...
以1日龄纯系的优质肉鸡A系(♂，A组)和惠阳胡须鸡(♂，B组)为试验动物，研究比较两纯系鸡28日龄回肠与盲肠黏膜菌群的组成及多样性。于第28日龄分别从2组中采集鸡2个肠段并提取黏膜细菌基因组DNA，应用16S rDNA基因序列技术，建立2个肠段黏膜细菌16S rDNA V3区的随机克隆文库。回肠文库分析发现，A组文库有86个序列共产生6个OTUs（Operational taxonomic uni...
以1日龄纯系的优质肉鸡A系(♂，A组)和惠阳胡须鸡(♂，B组)为实验动物，研究比较两纯系鸡1～28日龄胃肠道黏膜细菌微生物丛组成与动态变化特点。采用l6S rDNAV3 PCRDGGE的方法，分析第1、3、7、14、21、28日龄2组鸡胃肠道黏膜细菌基因组DNA。DGGE图谱中显示，28日龄2组鸡回肠泳道的条带数差异明显，嗉囊、腺胃及盲肠黏膜菌群结构的相似性均大于70%，十二指肠与空肠的相似性分...
运用PCR方法以保守引物NC5、NC13、NC13r和NC2扩增从内蒙古地区骆驼皱胃分离的3条斯氏副柔线虫（Parabronema skrjabini）rDNA的内转录间隔区1（ITS1）、5.8S序列和内转录间隔区2（ITS2）。将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGMT载体，用PCR技术及酶切鉴定阳性菌落，对阳性菌落质粒DNA进行测序。结果表明线虫1（P.sk1）扩增的ITS片段大小为837 ...
设计9个精料梯度的日粮饲喂干乳期成年荷斯坦奶牛，并对其瘤胃液中的部分细菌进行了分离，PCR-16S rDNA鉴定和动态检测。结果显示，以瘤胃液为原料，采用人工培养基共分离到56株细菌，并对7株具代表性的细菌进行了PCR扩增，经序列同源性比较，最终把细菌鉴定为牛链球菌(A0625、A1212、 0131)、蜡样芽孢杆菌（0113）、地衣芽孢杆菌（0091）、短小芽孢杆菌（0083）和嗜热链球菌(01...