搜索结果: 1-15 共查到“化学 HIV”相关记录15条 . 查询时间(0.093 秒)
采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法, 研究了34个HIV-1逆转录酶抑制剂S-DABOs类化合物的结构与活性之间的关系. 讨论了分子碎片大小、碎片区分参数以及分子全息长度对模型的影响. 以26个化合物构成的训练集所建最优模型的交叉验证相关系数q2为0.755, 相关系数r2 为0.949. 对8个化合物构成的测试集进行了预测, 其预测相关系数rpred2为0.95, 表明所建模型不仅有较高...
基于二氢烷氧苄基嘧啶酮(DABO)类非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)的构效关系研究,设计合成了2个新的6-(1H-吲哚-3-甲基)- 5-乙基-3H-嘧啶-4-酮类化合物,并采用C8166细胞进行了体外抗HIV活性测试,为新型S-DABO类非核苷类逆转录酶抑制剂结构修饰提出了新的设想.
用分子模拟方法研究HIV-1整合酶与咖啡酰基类抑制剂的相互作用
HIV-1整合酶抑制剂 整合酶 分子动力学模拟 咖啡酰基 没食子酰基
2009/12/25
用分子对接和分子动力学(MD)模拟方法研究了一类咖啡酰基和没食子酰基类HIV-1整合酶抑制剂与整合酶之间的相互作用模式, 结果表明该类抑制剂分子上的两个侧链基团(咖啡酰基或没食子酰基)与整合酶的DDE基序之间的相互作用对抑制整合酶活性起到关键作用. 当侧链基团为没食子酰基时, 可以提高该类抑制剂与整合酶的结合能力. 采用线性相互作用能方法(LIE)计算了该类抑制剂与整合酶之间的结合自由能, 预测值...
金丝桃素分子结构及其与HIV病毒蛋白酶作用的分子动力学研究
金丝桃素 HIV蛋白酶 分子动力学模拟 分子对接
2009/11/25
采用用计算化学方法研究金丝桃素分子结构特征, 并用分子动力学方法研究其与HIV蛋白酶的相互作用, 探讨其可能的抗HIV病毒作用机理. 结果表明, 金丝桃素分子结构具有刚性特征, 与HIV蛋白酶在酶的催化活性位点与ASP-A25 and ASP-B25以氢键作用相结合.
用分子对接方法研究了HIV-1整合酶(Integrase, IN)二聚体与3’ 端加工(3’ Processing, 3’-P)前的8 bp及27 bp病毒DNA的相互作用, 并获得IN与27 bp病毒DNA的特异性结合模式. 模拟结果表明, IN有特异性DNA结合区和非特异性DNA结合区; IN二聚体B链的K14, R20, K156, K159, K160, K186, K188, R199和...
用分子动力学(MD)模拟方法优化了HIV-1病毒DNA与整合酶(IN)二聚体(IN2)复合物模型结构, 并分析了HIV-1病毒DNA结合IN2后的构象变化. 结果表明, 按照HIV-1病毒DNA与IN2结合能力的强度, 病毒DNA可分为五个区域: 非结合区、强结合区1、弱结合区、强结合区2和反应区, 并用结合自由能计算验证了该分区的合理性. 与未结合IN2的病毒DNA相比, 复合物模型中病毒DNA...
藤三七中一个新黄烷醇和抗HIV活性成分
藤三七 藤三七醇A 黄烷醇 抗HIV活性
2008/6/11
利用各种色谱(硅胶和凝胶)方法, 从藤三七[Boussingaultia gracilis Miers var. pseudobaselloides Bailey]的70%(体积分数)的乙醇提取物中分离得到2个黄烷醇类化合物(1, 2)和4个黄酮类化合物(3~6). 采用UV, IR, MS 和1D, 2D NMR方法, 分别鉴定出如下化合物: 7-羟基-5-甲氧基-8-甲基-6-甲酰基-3,4-...
以酵母分泌型表达载体pPIC9k为基础, 通过一段柔性连接肽Linker构建含有人源化抗HIV-1 gp41单链抗体(ScFv41)和免疫诱导因子葡萄球菌肠毒素A(staphylococcal enterotoxin A, SEA)的融合表达质粒pPIC9k-SL41, 线性化后, 采用电转化法整合入巴斯德菌毕赤酵母GS115中, 经His+MutS表型鉴定、PCR分析以及G418筛选获得高拷贝重...
摘要 通过对自建的未开发化合物三维结构库进行药效团检索,得到了4个对HIV-1蛋白酶抑制活化的化合物,通过构象分析发现包含药效团的构象处于优势构象,而且4个结构都含有带两个邻位羟基的苯环和一个间位羰基的药效团以及公共子结构。通过计算发现它们的疏水参数都很小。在考虑满足包含药效团的结构特征和有适中的疏水参数两个因素的前提下,设计出了新的具有潜在抑制HIV-1蛋白酶活性的化合物。它们的结构都比检索得到...
抗HIV天然产物Calanolide A及其类似物的合成进展
Calanolide 全合成 抗-HIV
2007/12/22
摘要 Calanolide A是从藤黄科红厚壳属植物(Calophyllum lanigerum)中分离的一种吡喃型香豆素类化合物, 对HIV-1- RT有很强的抑制作用, 是目前抗HIV的热点先导物. 综述了该化合物及其类似物的全合成研究进展, 分析了它的合成路线, 讨论了各合成方法的优缺点.
HIV蛋白酶抑制剂——利迪链菌素的分子对接研究
HIV-1蛋白酶抑制剂 利迪链菌素 分子模拟 分子对接
2007/12/19
摘要 用分子对接的方法, 对利迪链菌素的抗HIV蛋白酶活性进行了研究. 为了更准确地反映利迪链菌素分子与酶蛋白结合的情况, 充分考虑受体活性部位的柔性, 采用了FlexX(初步对接)和Flexidock(精确对接)分两步将配体与受体进行对接. 在初步对接中, 设计了不同的受体活性部位来考察是否有结合水分子参与抑制剂与酶的结合. 对一种作用方式已知的非肽类HIV蛋白酶抑制剂Aha006进行的对接研究...
采用毛细管区带电泳紫外检测方法,在pH 8.0、浓度50 mmol/L的磷酸盐缓冲溶液及运行电压15 kV的条件下,测定了4种新合成的具有抗HIV-1活性的化合物(IG3,iso-C3,C3,MC3)与牛血清白蛋白(BSA)相互作用的结合常数。在缓冲溶液中加入不同浓度的BSA,通过测定化合物迁移时间的变化,计算得到了上述4种化合物与BSA的结合常数分别为1.07×104, 1.34×104, 8....
二酮酸类HIV-1整合酶抑制剂的定量构效关系
HIV-1整合酶抑制剂 二酮酸 遗传函数分析法 分子场分析法 药效团
2010/1/22
应用遗传函数分析法(GFA)和分子场分析法(MFA)对一系列二酮酸类整合酶抑制剂分别进行了二维和三维定量构效关系研究, 并对随机选择的5个化合物组成的测试集进行了预测, 外在预测的r2pred值分别达到0.987和0.759, 表明模型具有良好的预测能力, 同时利用药效团分析的方法, 验证了QSAR (quantitave structure-activity relationship)模型, 并...
An Efficient Synthesis of (1 S , 2 R )-1-Amino-2-Indanol, A Key Intermediate of HIV Protease Inhibitor, Indinavir
Manganese(III) oxidation imine reduction enantioselective hydrolysis 1-amino-2-indanol
2010/6/28
(1S,2R)-1-amino-2-indanol, a key component of an HIV protease inhibitor is synthesized in four steps starting from indanone. The Mn(OAC)3 mediated acetoxylation of indanone followed by fungus catalyze...