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元宝枫(Acer truncatum Bunge),属槭树科(Aceraceae)槭树属(Acer),因翅果形状像“金锭元宝”而得名,其抗旱、节水性能力强,是太行山石质山区和黄土丘陵区域重要的造林树种。APETALA2/Ethylene Responsive Factor (AP2/ERF)在植物抵御非生物胁迫中起着关键作用,然而对于元宝枫AP2/ERF的功能却不清楚。
白桦AP2/ERF家族基因的生物信息学分析
AP2/ERF 家族 生物信息学 转录因子 白桦
2021/7/13
从白桦转录组数据库中筛选出45条AP2/ERF家族蛋白,对其蛋白序列进行生物信息学分析和系统进化分析。结果表明,白桦AP2/ERF蛋白除了分为AP2、ERF、RAV和soloist家族外,还有2条蛋白不属于这些家族;不同组别白桦AP2/ERF蛋白在理化性质上存在差异;白桦AP2/ERF蛋白都含有磷酸化位点,但含有磷酸化位点的数量和种类上都有差异;白桦AP2/ERF蛋白大都定位在细胞核里,它们主要在...
ERF转录因子家族在甜菜块根发育中的功能分析
甜菜 块根发育 BvERF
2018/11/26
本研究以AP2/ERF保守结构域序列为检索序列在甜菜(Beta vulgaris)基因组数据中搜索并鉴定BvERF转录因子家族成员。通过系统分析, 发现甜菜基因组中共有68个BvERF家族基因, 系统进化分析将它们分为10个组。BvERF家族中15个成员与甜菜块根转入快速生长阶段有关, 其中Bv_ammr可能与甜菜丰产性能有关, Bv_ignp、Bv_sqfr和Bv_khde与苗龄113 d时丰产...
从小桐子(Jatropha curcas)幼苗的叶片组织中分离出一个新的AP2/ERF类转录因子的编码基因, 命名为JcERF3。序列分析显示其完整编码区为729 bp, 编码蛋白由242个氨基酸组成。推测的蛋白质与其他物种的ERF3蛋白具有很高的序列相似性, 并含有一个保守的AP2结构域。对启动子元件的预测显示存在一个乙烯响应元件(ERE), 暗示JcERF3的表达可能受到乙烯的调节。核定位信号...
植物AP2/ERF类转录因子研究进展
AP2/ERF转录因子 生物学功能 研究进展
2012/8/6
植物AP2/ERF是一个庞大的转录因子基因家族, 含有由60~70个氨基酸组成的AP2/ERF结构域而得名, 存在于所有的植物中。AP2/ERF转录因子参与多种生物学过程, 包括植物生长、花发育、果实发育、种子发育、损伤、病菌防御、高盐、干旱等环境胁迫响应等。AP2/ERF类转录因子参与水杨酸、茉莉酸、乙烯、脱落酸等多种信号转导途径, 而且是逆境信号交叉途径中的连接因子。文章对国内外近年来有关植物...