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旨在对秦川牛DKK1基因进行SNPs检测，并研究其与秦川牛体尺、肉质性状的相关性。本研究随机选择相近饲养条件下447头18～24月龄的秦川牛母牛，采用DNA直接测序技术并结合PCR-SSCP方法进行DKK1基因全区段遗传变异检测。运用SPSS16.0程序中最小二乘法拟合线性模型对DKK1基因不同基因型与秦川牛体尺（体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽）和肉质性状(背膘厚、眼肌面积...
本研究旨在分析CAPN1基因部分SNPs与中国西门塔尔牛经济性状的关联性。试验选取同龄、同场的135头中国西门塔尔牛为材料，利用PCRRFLP方法检测CAPN1 316和 CAPN1 4751 2个SNPs位点的多态性，并进行方差分析。结果发现，CAPN1 316 SNP位点与大理石花纹显著相关（P<0.05），杂合子AB基因型个体的大理石纹评分显著高于AA和BB基因型个体（P<0.05）；CA...
Evaluation of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) Genotyped by the Illumina Bovine SNP50K in Cattle Focusing on Hanwoo Breed
Hanwoo Breed, Polymorphic SNPs, Fixed SNPs, Minor Allele Frequency
2016/5/9
In the present study, we evaluated the informativeness of SNPs genotyped by the Illumina Bovine SNP50K assay in different cattle breeds. To investigate these on a genome-wide scale, we considered 52,6...
基于SNPs标记的猪肉DNA溯源技术的研究
猪肉 食品安全 DNA溯源 SNP
2012/2/16
建立溯源系统对肉类食品的管理和质量安全控制具有十分重要的作用。传统标记方法在肉类溯源的应用中受到了限制,基于生物个体本身基因组DNA特性而建立的DNA溯源标记方法可以解决这一难题。在国内首次对猪肉进行了基于SNPs标记的DNA溯源技术研究。采用RFLP-PCR方法检测了猪12个SNP候选标记,以期寻找到多态性信息含量丰富的SNP位点用于猪肉DNA溯源标记,结果发现6个SNP位点符合预期标准,分别是...
中国荷斯坦牛CXCR1基因第二外显子新SNPs与乳腺炎的关联分析
中国荷斯坦牛 CXCR1基因 乳腺炎抗性 单倍型
2013/12/3
通过研究中国荷斯坦牛趋化因子受体1（Chemokine (CXC motif) receptor1，CXCR1）基因多态性与乳腺炎间的相关性，找到对乳腺炎性状有显著影响的基因型和单倍型组合，为从遗传角度上解决奶牛乳腺炎问题提供参考。采用巢氏PCR、DNA测序和CRSPCRRFLP方法，对中国荷斯坦牛的CXCR1外显子2进行遗传多态性研究，分别利用SHEsis 软件和PHASE软件进行配对连...
为了解优质鸡MEF2A基因SNPs与屠体性状的相关性，以240只大恒优质肉鸡为材料，应用12对引物，采用PCRSSCP技术对肌细胞特异性增强子因子2A（MEF2A）基因进行多态性检测。结果在该研究群体中检测到MEF2A基因的3个SNPs位点46 023 nt (C→T，SNP1)、72 626 nt (G→A，SNP2)和89 232 nt (G→T，SNP3)。关联分析结果表明，MEF2A基因...
秦川牛及其杂种牛UCP3基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状的相关性
秦川牛 UCP3基因 PCRSSCP SNPs
2009/7/21
采用PCRSSCP 技术对秦川牛(QQ)及其杂种牛西秦(XQ) 、安秦(AQ) 、德秦(DQ) 4个群体共计229 头个体UCP3 基因进行SNPs多态性检测，发现了AA、AB、AC、AD 4种基因型。测序结果表明，AA 基因型为纯合型；AB 基因型在第820 位发生C→T突变；AC 基因型在第775位发生G→A突变；AD 基因型在951位发生G→T突变。方差分析结果表明，4 个群体中AA 基因...
秦川牛CS-1 基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状相关性研究
秦川牛 PCR-SSCP CS-1基因 SNPs
2009/7/20
【目的】检测秦川牛CS-1基因的SNPs多态性，并将其与秦川牛胴体和肉质性状进行关联分析。【方法】采用PCR-SSCP方法对485头秦川牛CS-1基因第3外显子进行SNPs多态性检测，分析其与部分胴体、肉质性状的关系; 【结果】在CS-1基因第3外显子191碱基处发现C→A突变，201碱基处发现C→T突变。检测到A和C两个等位基因，其基因频率分别位0.1381和0.8619。方差分析结果表明：胴体...
小型猪生长激素基因启动子区SNPs分析
小型猪 生长激素 基因启动子区 SNPs分析
2009/6/11
利用PCR-SSCP方法检测4种小型猪（五指山猪、巴马猪、香猪和藏猪）和2种中大型猪（达兰猪和长白猪）生长激素（GH）基因的单核苷酸多态性。发现小型猪中有3处碱基突变发生在5′调控区，对基因型和等位基因频率进行分析，4种小型猪生长激素5′侧翼区基因位点中，等位基因A和D为优势等位基因，与达兰猪和长白猪中的分布差异显著(P<0.05)。以上结果表明猪品种间的体型差异可能与GH基因5′调控区的基...
小型猪生长激素基因启动子区SNPs分析
小型猪 生长激素 启动子区 矮小
2013/12/9
利用PCR-SSCP方法检测4种小型猪（五指山猪、巴马猪、香猪和藏猪）和2种中大型猪（达兰猪和长白猪）生长激素（GH）基因的单核苷酸多态性。发现小型猪中有3处碱基突变发生在5′调控区，对基因型和等位基因频率进行分析，4种小型猪生长激素5′侧翼区基因位点中，等位基因A和D为优势等位基因，与达兰猪和长白猪中的分布差异显著(P<0.05)。以上结果表明猪品种间的体型差异可能与GH基因5′调控区的基...
EST-SNPs in bread wheat: discovery, validation, genotyping and haplotype structure
contigs DNA polymorphism DNA sequencing homoeologue sequence variants (HSVs) Triticum aestivum L.
2014/3/11
The present study involves discovery, validation and use of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in bread wheat utilizing 48 EST-contigs (individual contigs having 20-89 ESTs, derived from 2 to 11 d...
利用PCR-SSCP技术对萨福克、陶赛特、得克塞尔及滩羊4个绵羊品种358个个体Leptin基因等2、3外显子进行多态性分析，共检测到7个SNPs，其中新发现5个SNPs。测序结果表明，在外显子2上无突变。内含子2上存在A99G、G115A、C150T、C171T位点。外显子3上，存在G271A；C316A；G387T位点。外显子3上的SNPs使编码的氨基酸发生变化。统计分析表明A99G、C150...
以京海黄鸡为材料，采用PCR-SSCP技术测定IGF-Ⅱ基因3个SNPs位点，同时分析它们对不同周龄体重及产蛋性状的遗传效应。结果显示，3个位点分别发生C→G、G→C、G→A的单碱基突变，各检测到3种基因型，P1位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态（P＜0.05）。最小二乘方差分析表明，AA与BB基因型个体300日龄产蛋数存在显著差异（P<0.05），A为增效等位基因，B为减效等位基因；C...
摘要：以京海黄鸡为材料，采用PCR-SSCP技术测定了IGF-Ⅱ基因3个SNPs位点，同时分析了它们对不同周龄体重及产蛋性状的遗传效应。结果显示，3个位点分别发生了C→G、G→C、G→A的单碱基突变，各有3种基因型，P1位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态（P＜0.05）。最小二乘方差分析表明，AA与BB个体300日龄产蛋数存在显著差异（P<0.05），A为增效基因，B为减效基因；CD型1...