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2013年3月27日，国际学术期刊BMC Genomics在线发表了中科院上海生科院计算生物学所杨力研究组和生化与细胞所陈玲玲研究组的最新合作研究论文Prediction of constitutive A-to-I editing sites from human transcriptomes in the absence of genomic sequences。该项研究发展了一新的计算分析流...
研究首次实现高通量小RNA芯片非标记检测（图）
首次 实现 高通量小RNA芯片 非标记检测
2011/10/17
microRNA是近年来发现的一种单链的短链RNA，长度约22个碱基，在动植物及人类中广泛存在，与发育、分化、凋亡、脂肪代谢、病毒感染和癌症等多种重要生物学过程有密切的联系，并显示出作为癌症、心血管等重大疾病等方面的新的分子标记物的巨大潜力，是近十年来的一个研究的热点。对microRNA表达谱进行高通量、低成本的检测对于该领域的发展具有重要的意义。
第二代测序技术又称作深度测序技术，应用到RNA上统称作RNA-seq或RNA测序，它已成为基因表达和转录组分析的重要手段。第二代转录组测序数据中含有大量不编码蛋白质的ncRNA序列，因为它们像宇宙中的暗物质一样难以识别和有重要功能，也被称为“基因组暗物质”。由于数据量巨大，保守性差，又有噪音干扰，这些“暗物质”的识别成为表观遗传学和调控网络研究的瓶颈。piRNA是数量最大的一类ncRNA，主要是通...
为探索细菌表达目标基因dsRNA介导的RNAi技术是否在家蚕Bombyx mori可行, 本研究引入了在其他物种中广泛应用的细菌表达dsRNA的RNAi系统: HT115细菌株和L4440质粒。利用L4440载体两端含有T7启动子的特点, 设计并构建了针对家蚕核受体FTZ-F1基因的RNA干扰（RNA interference）载体, 将构建好的质粒转入大肠杆菌Escherichia coli H...
研究人员发现运送RNA至细胞线粒体的蛋白（图）
RNA 细胞线粒体 蛋白
2010/8/17
加州大学洛杉矶分校（UCLA）的约翰逊综合癌症中心与化学系、生物化学系以及病理学和实验室医学系的研究人员共同揭示了一种必不可少的蛋白在往返运送RNA至细胞线粒体中的作用。图片来源：Maureen Heaster.
反义试剂是专门为线虫micro RNA研发的。将文章发表在生物医学中心开放阅览杂志《沉默》（Silence）上的研究人员研发出了第一类能够广泛应用在模式生物上的高效和选择性地抑制miRNA的试剂。
Ever since RNA interference was discovered, in 1998, scientists have been pursuing the tantalizing ability to shut off any gene in the body — in particular, malfunctioning genes that cause diseases su...
RNA干涉的原理与应用
RNAi 双链RNA 基因表达沉寂
2009/11/25
介绍了RNA干扰(RNA interference，RNAi)的机理，阐述了RNAi的生物学意义，并具体论述了RNAi的作用，指出RNAi已经成为一种研究基因功能的有力工具，并且有希望在对疾病的防御及治疗中发挥重要的作用。
NS5B与HCV负链RNA 3′末端特异性结合的分析
丙型肝炎病毒(HCV) NS5B 复制体
2008/10/24
NS5B是RNA依赖性RNA聚合酶，在病毒RNA合成过程中起到中心催化酶的作用.在大肠杆菌中表达和提纯了GST-NS5B融合蛋白，应用紫外交联试验（UV cross-linking）检测NS5B与丙型肝炎病毒(HCV)负链RNA 3′末端的结合，确定NS5B是否参与HCV负链RNA 3′末端复制体的形成.NS5B可与HCV负链RNA 3′末端发生结合，这种结合存在量效关系，比与正链RNA 3′UT...
RNA结合蛋白是基因表达的重要调节因子.RNA-蛋白质印迹（Northwestern blot）是近年来国外建立的筛选这类因子的重要方法之一.应用这一方法从肝细胞株HepG2 cDNA文库中成功筛选到乙型肝炎病毒表面抗原转录后调节片段互相作用蛋白表达克隆.结果显示：该蛋白与探针结合特异性强，经三轮筛选后，100%克隆为阳性克隆；PCR和EcoRⅠ酶切初步鉴定, 编码该蛋白的cDNA长约1 kb. ...
《自然》：科学家发现一类新的小RNA分子
RNA分子 编码蛋白
2008/5/16
RNA的重要作用就是真实传达DNA的信息，从而让细胞能够制造出各种蛋白。近年来，分子生物学家越来越多地发现，一类很短的RNA分子同样直接影响着基因编码蛋白过程，比如是哪个基因来编码蛋白，制造多少蛋白。此外，科学家发现一些小RNA在保护遗传物质的完整性方面也扮演着特殊的角色。
RNA干扰的实验方法及应用
实验方法 RNA干扰
2008/3/3
RNA干扰(RNA interference，RNAi)就是把与内源mRNA编码区同源的长度为19～23 bp的外源双链RNA(double stranded RNA，dsRNA)导入细胞中，通过一系列细胞内反应引发细胞中相应mRNA的降解，从而导致特定基因表达沉默的一种技术；是真核生物中普遍存在的抵抗病毒入侵，抑制转座子活性及基因表达的监控机制。《Science》和美国科学促进会将RNAi技术...