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细胞内RNA作为指导蛋白质翻译的模板,受到了多种调控和修饰。不同的情况下,基因产生的转录本表达水平会发生改变,乃至产生不同的转录异构体,进而形成多种蛋白质亚型。在RNA转录本水平进行研究,可以更加精准地描绘癌症转录组的改变。然而,目前大部分的研究是在基因水平,而忽视了RNA转录本的多样性,尚未有研究系统性地分析大规模人源癌细胞系的转录本图谱,并揭示其调控及与抗肿瘤药物敏感性的关系。
2022年10月6日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈玲玲研究员受邀在Nature Methods上发表了题为“Towards higher-resolution and in vivo understanding of lncRNA biogenesis and function”的主题评论,重点论述了新技术的应用为长非编码RNA研究带来的前沿进展以及今后研究的...
中国科学院微生物研究所向华/李明研究团队此前发现一类全新的可以护卫CRISPR-Cas的双RNA型毒素-抗毒素系统CreTA(Science, 2021),进一步研究发现CreTA起源于mini-CRISPR结构,但其重复序列repeat发生了高度退化(Nucleic Acids Res, 2021)。CreTA的repeat序列为何会发生这一退化,其进化驱动力是什么,科学家们尚不清楚。2022年...
2022年7月1日,中科院合肥研究院强磁场中心林文楚课题组在环形RNA参与小细胞肺癌发生发展的研究中取得重要进展。相关研究成果发表在国际著名期刊Molecular Cancer上。该研究发现环形RNA作为分子海绵可以同时结合多个miRNA,进而调控单一信号通路参与肿瘤的发生发展进程,该研究成果有望为小细胞肺癌提供新的分子标志物和治疗靶点。
2022年5月25日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈玲玲研究员受邀在Annual Review of Cell and Developmental Biology在线发表了题为“Biogenesis and Regulatory Roles of Circular RNAs”的综述论文。该论文从不同类型环形RNA的研究历史入手,主要针对外显子反向剪接产生的环形R...
大多数环状 RNA 是由前体 mRNA 的外显子反向剪接产生的。最近的技术进步部分克服了它们的环状构象和序列与线性同源 mRNA 重叠的问题,从而可以更好地了解它们的细胞作用。根据它们的定位和与 DNARNA 和蛋白质的特定相互作用,环状 RNA 可以调节转录和剪接,调节细胞质 mRNA 的稳定性和翻译,干扰信号通路,并在不同的生物学和病理生理学环境中作为翻译的模板。 环状RNA在干扰细胞过程、...
2022年5月17日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲团队受邀在国际学术期刊Cell在线发表了题为“Circular RNAs: characterization, cellular roles and applications”的综述论文。该论文系统梳理了针对环形RNA研究的生物学技术手段,总结了其以非编码RNA形式参与调控细胞内基因表达和通过编码功能性小肽调控相关生物学过程的最新研究成...
2022年5月9日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上发表了题为“APIP5 functions as a transcription factor and an RNA-binding protein to modulate cell death and immunity in rice”的研究论文。该论...
近两年来,多项研究发现染色质中的新生RNA上含有m6A修饰,说明这些m6A修饰伴随着转录产生。真核生物的转录包括转录起始、暂停与释放、延伸和终止等多个步骤。早期的转录暂停以及暂停后命运选择(继续延伸还是降解)是高等生物基因转录的限速步骤,而m6A修饰在此过程中的研究还很少。
2022年1月27日,浙江大学生命科学学院金勇丰教授课题组在Science Advances上在线发表研究论文“Hidden RNA pairings counteract the “first-come, first-served” splicing principle to drive stochastic choice in Dscam1 splice variants”。该研究揭示了RNA...
2021年11月22日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国科罗拉多大学安舒茨医学分校的研究人员观察到一种来自雀麦花叶病毒的模拟tRNARNA分子如何形成复杂的三维结构,并能够改变它的形状以劫持宿主蛋白。通过使用低温电镜(cryo-EM)技术,这种让科学家们数十年来难以捉摸的过程的细节被揭示出来。相关研究结果发表在2021年11月19日的Science期刊上,论文标题为“A vi...
在真核生物中,三种结构保守的RNA聚合酶(Pol I,Pol II和Pol III)分别介导不同基因的转录,合成不同类型的RNA。其中Pol I定位在细胞核核仁中,主要转录rRNA,其转录活动可达整个胞内转录活动的60%,对于核糖体合成至关重要。临床研究证明,Pol I的突变会导致特雷彻·柯林斯综合征、面骨发育不全以及严重神经变性等疾病的发生,此外Pol I转录机制被认为是重要的抗癌治疗的药物靶点...
环形RNA在人类肿瘤发生过程中发挥着重要的基因调控作用,但在胃癌中的作用模式仍不清楚。近期,我国科学家发现环形RNA能够抑制胃癌转移,研究成果发表在《美国科学院院刊》,标题为“CircURI1 interacts with hnRNPM to inhibit metastasis by modulating alternative splicing in gastric cancer”。
SRSF1作为一个重要的剪切因子,在pre-mRNA的剪切、mRNA稳定性及转录延伸等重要生物学过程中发挥着重要功能,但是其在iNKT细胞发育过程中的生物学功能尚不清楚。该研究利用T细胞特异性缺失SRSF1的小鼠,系统的分析了SRSF1对iNKT细胞发育、分化以及功能的调控作用,通过一系列的实验证实SRSF1可以内源性的调控iNKT的早期发育以及iNKT2的分化。SRSF1缺失后iNKT细胞的增殖...
2021年7月30日,国际知名学术期刊《科学》(Science)以Research Article形式发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈玲玲研究组和刘珈泉研究组的合作研究成果“lncRNA SLERT controls phase separation of FC/DFCs to facilitate Pol I transcription”,并获同期Pers...

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