搜索结果: 121-135 共查到“理论生物物理学”相关记录156条 . 查询时间(2.337 秒)
一个基于Blast程序的多重序列对齐程序——Mblast
Blast程序 序列多重对齐
2008/6/16
核酸序列和蛋白质序列的相似性分析日益成为生物信息学研究的核心内容.NCBI的Blast程序是进行此类分析的最有力工具.虽然它提供了初步的将多条序列进行综合对齐的分析方案，但是实际效果却很不理想.在对Blast程序的输出结果进行仔细分析的基础上，基于“求同存异”的思想，我们编制了一个多重序列对齐程序Mblast.该程序与目前流行的序列多重对齐程序相比，更容易检出序列的同源区.
钾离子通道两态跳跃的通透机制
方程 钾离子通道
2008/5/21
采用两态跳跃模型研究离子通道的通透机制，从两态动力学方程得到了平衡态下的能斯特方程、稳态条件下的米氏动力学关系。得出: 若电压小于100 mV，电导-电压关系是线性的；在电流-浓度关系中，电流具有饱和特性。这些与实验结果是一致的。此外，还讨论了钾离子通道到达稳态前的暂态过程，并用特征时间来描述这一过程。发现采用两态跳跃模型用较少的参数就可以说明离子通透的机制。
甲虫抗冻蛋白热滞活性的二维吸附结合模型
抗冻蛋白(Antifreeze protein (AFP)) 热滞(Thermal hysteresis (TH)) 吸附(Adsorption) 冰晶表面覆盖度(ice surface coverage)
2008/5/21
甲虫抗冻蛋白是一种具有规则结构的昆虫抗冻蛋白。在相同浓度条件下甲虫抗冻蛋白比鱼类抗冻蛋白有更高的热滞活性，目前已成为人们重点研究的一类抗冻蛋白。根据甲虫抗冻蛋白的结构特点及其在冰晶表面的吸附模式，应用二维吸附结合模型计算分析了具有6-11个β－螺旋（β－helix）结构片段的甲虫抗冻蛋白变体分子，得到了它们的热滞活性随溶液浓度变化的规律，特别是热滞活性与甲虫抗冻蛋白的β－螺旋结构片段数的关系。结果...
基于遗传算法的基因芯片图像网格定位
遗传算法(Genetic Algorithm) 变形模板匹配(Deformable template matching) 基因芯片(Genetic chip)
2008/5/21
对基因芯片荧光图像进行网格定位是进行芯片分析的前提与关键。利用变形模板匹配方法,基因芯片的自动网格定位问题转化为优化问题,从而用遗传算法求解。遗传算法是一种模拟自然界进化过程的启发式优化算法,具有高效及可收敛到全局最优点的特点。实验证明该方法具有良好的准确性与可靠性。
基于替代数据思想的复杂度归一化方法及其在心电信号分析中的应用
心电信号 替代数据 归一化复杂度 C0复杂度(ECG Surrogate data Normalization of complexity measures C0 complexity)
2008/5/21
基于替代数据（Surrogate）思想的复杂度归一化方法，克服了一般复杂度对信号采样长度与采样频率的敏感性。文章对在生物医学信号复杂度分析中最有潜在应用价值的近似熵和C0复杂度进行了归一化。应用该方法可以有效地反映人体心脏某些病理状态之间的差别。同时，通过比较各种复杂度指标发现，C0复杂度和近似熵对采样长度的敏感性最弱，适用于短数据量的信号分析。
基于微阵列数据的基因网络预测方法研究进展
贝叶斯网 微阵列 基因网络 布尔网络
2008/5/21
DNA微阵列技术可同时定量测定成千上万个基因在生物样本中的表达水平，从这一技术获得的全基因组范围表达数据为揭示基因间复杂调控关系提供了可能。研究人员试图通过数学和计算方法来构建遗传互作的模型，这些基因调控网络模型有聚类法、布尔网络、贝叶斯网络、微分方程等。本文对网络重建计算方法的研究现状进行了较为全面的综述，比较了各种模型的优缺点，并对该领域进一步的研究方向进行了展望。
基于小波神经网络的图像去噪算法
中值滤波 图像去噪 小波神经网络 保真度
2008/5/21
生物医学图像在成像时不可避免地受到噪声影响，因此噪声去除是生物医学图像处理的一项重要研究课题。将小波神经网络引入图像去噪领域中，通过多种技术优化网络学习过程，最终建立一种图像去噪新算法。实验结果表明，该算法在去除噪声上优于传统的中值滤波等方法，并具有较强的鲁棒性；同时能够最大限度地保护图像的细节信息，具有很好的保真度。
结合基因功能分类体系Gene Ontology筛选聚类特征基因
聚类特征基因 分类体系 基因功能
2008/5/21
使用两套基因表达谱数据，按各基因的表达值方差，选择表达变异基因对样本聚类，发现一般使用方差较大的前10%的基因作为特征基因，就可以较好地对疾病样本聚类；对不同的疾病，包含聚类信息的特征基因有不同的分布特点。在此基础上，我们提出结合基因功能分类体系Gene Ontology，进一步筛选聚类特征基因的方法。通过检验在Gene Ontology(GO)中的每个功能类中的表达变异基因是否非随机地聚集，寻找...
静电和疏水效应对胰岛素二聚体稳定性的影响
胰岛素二聚体(Insulin dimer) 分子表面(Molecular interface) 静电作用(Electrostatic interactions) 疏水作用(Hydrophobic effects)
2008/5/21
从猪胰岛素二聚体的结构出发,着重研究了胰岛素二聚体单体之间的静电和疏水相互作用,用连续介质模型的有限差分方法计算得到胰岛素二聚体的静电势,用溶剂可接近表面(ASA)模型分析了分子表面积及疏水性,还考察了不同pH值对胰岛素二聚体静电和疏水相互作用的影响。结果分析表明,当pH值处于弱酸弱碱范围内时(4.6-8.5),静电相互作用能和疏水自由能都呈现出较小的值,当 pH为6.2时,疏水性出现一个明显的峰...
在分析了溶液中抗冻糖蛋白与冰晶表面的相互作用的基础上,提出了在抗冻糖蛋白溶液中冰晶沿c轴方向生长的理论。给出了冰晶在抗冻糖蛋白溶液中生长速率的定量计算,而且理论值与实验结果有较好的符合,解释了冰晶在抗冻糖蛋白溶液中生长速率和生长习性的各向异性。
利用支持向量机预测II类MHC分子结合多肽
主要组织相容性复合体(MHC)(MHC) 人类白细胞抗原(HLA)(HLA) 支持向量机(SVM)(SVM) 预测(Prediction)
2008/5/20
抗原多肽序列与主要组织相容性复合体(MHC)分子的结合是引起T细胞免疫应答的先决条件。对结合多肽序列的预测可以大大减少实验所需的费用和时间。我们用支持向量机(SVM)对HLA DR4(B1*0401)编码的Ⅱ类MHC分子结合多肽进行了预测,将650个已知结合能力的多肽序列,按3:1的比例分成训练组和测试组进行训练和测试。对结合多肽,预测的准确率达到77.62%,对不结合多肽,准确率达到71.7...
利用分组重量编码预测细胞凋亡蛋白的亚细胞位置
分组重量编码(Encoding Based on Grouped Weight) 凋亡蛋白(Apoptosis protein) 组分耦合算法(Component-coupled algorithm) 亚细胞定位预测(Subcellular location prediction)
2008/5/19
从氨基酸的物化特性出发，利用物理学中“粗粒化”和“分组”的思想，提出了一种新的蛋白质序列特征提取方法——分组重量编码方法（Encoding Based on Grouped Weight，简记为EBGW）。采用组分耦合算法作为分类器，从蛋白质一级序列出发对细胞凋亡蛋白的亚细胞定位进行研究。采用Zhou和Doctor使用的数据集，Re-substitution和Jackknife检验总体预测精度分别...
蚂蚁群落优化算法在蛋白质折叠二维亲-疏水格点模型中的应用
蛋白质折叠 HP模型 蚂蚁群落优化算法
2008/5/19
氨基酸的亲疏水格点模型是研究蛋白质折叠的一种重要的简化模型，其优化问题是一个非确定型的多项式问题。采用蚂蚁群落优化算法对这一问题进行了研究，对测试数据的计算结果表明，在一定规模下，此算法能够有效地获得亲-疏水格点模型的最优解，其效率优于传统的Monte Carlo仿真等方法。
棉纤维超微结构的研究
棉纤维(Cotton fiber) 超微结构(Ultrastruture) 品质性状(Qualitative characters) 取向参数(Orientational parameter) X射线衍射(X-ray diffraction)
2008/5/19
应用X射线衍射技术研究了棉纤维的超微结构,其结果是:棉纤维细胞壁微晶区沿纤维轴方向的长度为12.7nm,垂直于纤维轴方向的宽度为6.6nm;沿纤维轴方向的畸变为0.69%,垂直于纤维轴方向的畸变为3.28%。棉纤维在生长过程中其细胞次生壁S2层的平均微原纤螺旋角随花后生长天数的增加逐渐减小;纤维素微晶粒间的取向度逐渐增加;花后5-14天结晶度缓慢增加;14-17天陡然增加,17天后极缓慢地趋向稳定...