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水稻土中的砷形态直接影响到水稻根系对砷的吸收及转移，而微生物是影响砷形态变化的重要因素，同时水稻田干湿交替所带来的有氧和厌氧条件的转化为不同类型的砷代谢微生物提供了合适的环境条件。在纯培养试验的研究中，微生物对砷的生物转化过程已经相对清楚，但介导微生物砷转化过程的相关基因在水稻土的分布、丰度和多样性仍未知。