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华南植物园在石仙桃叶绿体基因组进化和系统学研究取得进展(图)
石仙桃 叶绿体基因 进化 系统学
2023/6/11
兰科石仙桃属植物(Pholidota Lindl. ex Hook.)分布于亚洲热带、亚热带地区,世界约有30种,我国产约15种。该属植物具有重要的经济价值,其中有些类群为传统中药材,俗称石橄榄。然而,以往由于采样不足、缺乏足够的信息位点及有限的基因组信息,该属和近缘属间的关系和系统地位尚不清楚,石仙桃属的分类问题尚存在争议。
在信息时代传承红色基因的研究
信息时代 红色基因 传承
2018/11/19
新时期传承和弘扬"红色基因"就要主动适应网络时代特点规律,不断创新依托网络传承的思维理念、工作模式、方法手段,充分发挥"网络+"的倍增作用,增加官兵的思想政治素质,提升部队的战斗力。
近日,国际学术期刊《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学、清华大学等单位的科研人员合作的基因调控网络建模的研究成果,提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画顺式调控元件和反式调控元件相互作用的数学模型,将基因调控网络的建模研究从编码基因推进到了非编码区域的调控元件,有望用来注释疾病等表型相关的遗传变异。
基因表达式编程在组合预测建模中的应用
组合预测 基因表达式编程 自动建模 函数挖掘
2012/3/12
介绍一种利用基因表达式编程的方法来自动生成非线性函数的组合预测模型,并进行误差估计分析, 改变过去只依靠各个子方法的简单线性相加,不能很好地反映非线性真实世界的传统组合预测建模方法.通过对我国CPI的真实历史数据验证, 验证结果表明: 与传统的ARIMA,灰色GM(1,1), BP神经网络和线性组合预测四种方法对比,基因表达式编程建立的组合预测模型所预测的数据准确度明显提高.
基于随机森林的潜在k近邻算法及其在基因表达数据分类中的应用
随机森林 潜在k近邻 基因表达数据
2012/5/21
随机森林被广泛应用于包括癌症诊断在内的生物信息学领域. 从自适应k近邻的角度分析了随机森林的分类机理,分析其存在的信息损失, 据此提出一种新的投票机制,称为基于随机森林的潜在k近邻算法RF-PN,能够充分利用决策树上的OOB样本信息, 显著改善随机森林的分类性能.6个癌症基因表达数据集上的对比实验表明,RF-PN的分类准确率优于原算法.