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牛油果属樟科鳄梨属常绿乔木,原产于中美洲。为阐释牛油果的遗传信息,中国科学院西双版纳热带植物园植物基因组演化与次生代谢研究组利用NGS、PacBio HiFi、ONT、Pore-C等测序技术对西印度品种的牛油果进行了全基因组测序,并组装了841.6Mb无间隙的牛油果基因组序列。
本发明公开了一种用于二倍体D基因组棉种或四倍体棉种鉴定的引物及方法,引物du01的正向引物序列如SEQ ID No.1所示,引物du01的反向引物序列如SEQ ID No.2所示。本发明的特异性引物du01能在以二倍体D基因组棉种或四倍体棉种为模版的PCR中扩增出特异性的750bp的核苷酸序列。而在以A、B、C、E、F、G、K组的10个二倍体棉种为模版的PC...
本发明属于分子生物学领域,具体涉及一个适用于棉花A基因组和包含A亚基因组棉种(Gossypium)的鉴别。使用本发明的特异PCR引物,根据其PCR产物是否能凝胶成像,可区分、鉴别A(亚)基因组棉种与B,C,D,E,F,G,K棉种。本发明所述引物仅在A组二倍体基因组棉种和四倍体棉种中产生特异条带,在B、C、D、E、F、G、K组的14个二倍体棉种无产物。
牛油果(Persea americana Mill.)属樟科鳄梨属常绿乔木,为著名的热带水果之一,原产于中美洲,果实富含多种不饱和脂肪酸,口感细腻,香气独特。为了深入理解牛油果的遗传信息,中国科学院西双版纳热带植物园(以下简称“版纳植物园”)植物基因组演化与次生代谢研究组,利用NGS、PacBio HiFi、ONT、Pore-C等测序技术对西印度品种的牛油果进行了全基因组测序,并成功组...
中国科学院西双版纳热带植物园(以下简称“版纳植物园”)植物系统发育与多样性保护研究组选取黄杞(Engelhardia roxburghiana)为研究物种,利用生物信息学软件STACKS,探索使用不同参考基因组对SNP Calling的影响。该研究围绕两种不同参考基因组:使用近缘种(即枫杨:Pterocarya stenoptera)作为参考基因组,以及利用物种本种(即黄杞)作为参考基...
茶果樟(Cinnamomum chago B.S. Sun et H.L. Zhao)是受国家II级重点保护的极小种群野生植物,仅分布于云南省漾濞县和云龙县等地。茶果樟的果实被当地人称为“茶果”,具有清热明目功效,常炒熟后在市场上售卖,是深受当地人喜爱的“坚果”,有悠久的利用历史。研究还显示,茶果樟的果实含有大量月桂酸和癸酸,具有工业利用潜力;其树形优美,木材质地坚硬、有香味,是极具开...
2024年3月29日,由中国科学院动物研究所(以下简称“动物研究所”)牵头承担的国家重点研发计划“典型脆弱生态系统保护与修复”重点专项“国家重点保护动物基因组多样性评估与遗传拯救技术”项目启动暨实施方案论证会在北京召开。
质体是真核细胞中具有半自主遗传的细胞器,是植物光合作用的场所。通常,植物质体基因组在进化上是偏保守的。然而,随着越来越多的植物物种被测序,质体基因组表现出了一定的变异。这种变异大多数发生在异养植物中,与光合作用能力的丧失以及相关基因的降解与丢失有关。此外,在某些特殊的光合自养类群中也发现质体基因组有较大变异的情况,如石松类(lycophytes)、豆科(Fabaceae)、桔梗科半边莲亚科(Lob...
寄生植物是通过特化器官吸器(haustorium)从寄主植物中获取养分和无机盐,这个习性在被子植物中至少独立演化了12次。旋花科菟丝子属(Cuscuta L.)是全球广布的寄生植物代表,已记载超过200个种。在形态上,菟丝子属植物属于茎寄生,根和叶片已完全退化,光合作用能力非常微弱或者完全失去。菟丝子属质体基因丢失和基因组功能退化已被多次报道,但其基因基因组功能退化和演化规律尚未明晰...
2024年4月26日,中国科学院海洋研究所陈楠生课题组在硅藻基因组学研究方面取得新进展,成功构建了首个热带骨条藻(Skeletonema tropicum)的高质量染色体水平参考基因组,相关研究成果发表在国际数据集期刊Scientific Data(Q1,IF=9.8)。这是该团队在2023年成功构建海洋优势浮游植物玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)染色体水平基因组之后完成的第二...
巨核细胞(Megakaryocyte,MK)是骨髓中产生血小板的血细胞,血小板在止血、伤口愈合以及炎症反应中具有重要的作用。然而目前血小板输注完全依赖于健康供者捐献,随着血小板输注需求量的增加,供者来源短缺,血小板难以在体外长期保存,血小板的输注存在巨大的供应缺口。而巨核细胞的多倍体化对于血小板产生非常重要,是高效生成功能性血小板的重要保障。因此解析巨核细胞多倍体化调控机制对于突破血小板再生技术瓶...
反刍动物中包含许多重要的家畜,它们拥有独特的包含多个胃室的消化系统。目前对于反刍动物胃肠道中细菌、古细菌的研究已取得了显著进展。而病毒同样是反刍动物胃肠道微生物群的关键组成部分,在塑造微生物组成方面发挥重要作用,并且由于病毒的微生物宿主范围狭窄的特性可以作为一种精确调控微生物宿主以抑制病原细菌和控制甲烷排放的系统性工具。然而对于反刍动物胃肠道中的病毒群落生态结构仍然缺乏全面的了解。2024年4月4...
自30年前“人类基因组计划”(HGP)启动以来,完整和准确的参考基因组一直是生物医学研究领域致力追求的目标。2022年4月,Science期刊发表了首个人类端粒到端粒(T2T)完整基因组——T2T-CHM13,填补了GRCh38版本中剩余的8%人类基因组序列空白,成为有史以来第一个高质量的单倍体人类基因组。2024年来研究证实人种之间存在显著的基因组序列差异,而参考基因组与待测样本之间的差异会严重...
近日,中国工程院院士、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)教授包振民团队开发国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具(PanSyn,https://github.com/yhw320/PanSyn)。相关成果发表于《自然-实验手册》。该成果是包振民团队长期积累的丰富基因组学分析方法和工具研发经验的系统总结和提升。
湖南报春苣苔(Primulina hunanensis K. M. Liu & X. Z. Cai)为苦苣苔科(Gesneriaceae)报春苣苔属(Primulina Hance)一种多年生草本植物,对于弱光、贫瘠的洞穴环境适应能力非常强,在物种进化和对环境的适应上独具特色。湖南报春苣苔花繁艳丽,株形优美,具有极佳的园艺种植价值。但其生境特殊,分布范围极窄,仅在湖南省的一个县内有发现,估计野生种...

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