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中国科学院牛油果无间隙参考基因组组装助力脂肪酸生物合成和抗病性相关基因鉴定(图)
基因 脂肪酸 生物合成
2024/5/16
牛油果属樟科鳄梨属常绿乔木,原产于中美洲。为阐释牛油果的遗传信息,中国科学院西双版纳热带植物园植物基因组演化与次生代谢研究组利用NGS、PacBio HiFi、ONT、Pore-C等测序技术对西印度品种的牛油果进行了全基因组测序,并组装了841.6Mb无间隙的牛油果基因组序列。
中国科学院昆明植物研究所,昆明植物所成功解析茶果樟的全基因组(图)
解析 基因 系统发育
2024/5/15
茶果樟(Cinnamomum chago B.S. Sun et H.L. Zhao)是受国家II级重点保护的极小种群野生植物,仅分布于云南省漾濞县和云龙县等地。茶果樟的果实被当地人称为“茶果”,具有清热明目功效,常炒熟后在市场上售卖,是深受当地人喜爱的“坚果”,有悠久的利用历史。研究还显示,茶果樟的果实含有大量月桂酸和癸酸,具有工业利用潜力;其树形优美,木材质地坚硬、有香味,是极具开...
国家重点研发计划“典型脆弱生态系统保护与修复”重点专项 “国家重点保护动物基因组多样性评估与遗传拯救技术”项目启动暨实施方案论证会在京召开(图)
生态系统 基因组 多样性 遗传 论证会 濒危动物
2024/5/9
昆明植物所在禾本目质体基因组变异及其适应性进化上取得新进展(图)
基因 进化 真核 细胞
2024/5/15
质体是真核细胞中具有半自主遗传的细胞器,是植物光合作用的场所。通常,植物质体基因组在进化上是偏保守的。然而,随着越来越多的植物物种被测序,质体基因组表现出了一定的变异。这种变异大多数发生在异养植物中,与光合作用能力的丧失以及相关基因的降解与丢失有关。此外,在某些特殊的光合自养类群中也发现质体基因组有较大变异的情况,如石松类(lycophytes)、豆科(Fabaceae)、桔梗科半边莲亚科(Lob...
海洋所发表热带骨条藻高质量染色体水平参考基因组(图)
高质量染色体 基因 生态系统
2024/4/27
2024年4月26日,中国科学院海洋研究所陈楠生课题组在硅藻基因组学研究方面取得新进展,成功构建了首个热带骨条藻(Skeletonema tropicum)的高质量染色体水平参考基因组,相关研究成果发表在国际数据集期刊Scientific Data(Q1,IF=9.8)。这是该团队在2023年成功构建海洋优势浮游植物玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)染色体水平基因组之后完成的第二...
巨核细胞(Megakaryocyte,MK)是骨髓中产生血小板的血细胞,血小板在止血、伤口愈合以及炎症反应中具有重要的作用。然而目前血小板输注完全依赖于健康供者捐献,随着血小板输注需求量的增加,供者来源短缺,血小板难以在体外长期保存,血小板的输注存在巨大的供应缺口。而巨核细胞的多倍体化对于血小板产生非常重要,是高效生成功能性血小板的重要保障。因此解析巨核细胞多倍体化调控机制对于突破血小板再生技术瓶...
华中科技大学生命科学与技术学院陈卫华教授和佛山科学技术学院刘庆友教授合作在反刍动物消化道噬菌体基因组挖掘领域取得新进展(图)
陈卫华 刘庆友 反刍动物 噬菌体 消化道 病毒 Microbiome
2024/5/6
自30年前“人类基因组计划”(HGP)启动以来,完整和准确的参考基因组一直是生物医学研究领域致力追求的目标。2022年4月,Science期刊发表了首个人类端粒到端粒(T2T)完整基因组——T2T-CHM13,填补了GRCh38版本中剩余的8%人类基因组序列空白,成为有史以来第一个高质量的单倍体人类基因组。2024年来研究证实人种之间存在显著的基因组序列差异,而参考基因组与待测样本之间的差异会严重...
基因组系统解析工具开发研究取得重要进展(图)
解析工具 非模式 海洋生物
2024/4/16
近日,中国工程院院士、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)教授包振民团队开发国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具(PanSyn,https://github.com/yhw320/PanSyn)。相关成果发表于《自然-实验手册》。该成果是包振民团队长期积累的丰富基因组学分析方法和工具研发经验的系统总结和提升。
武汉植物园完成穴居濒危植物——湖南报春苣苔的完整线粒体基因组解析(图)
植物 线粒体基因 解析
2024/5/14
湖南报春苣苔(Primulina hunanensis K. M. Liu & X. Z. Cai)为苦苣苔科(Gesneriaceae)报春苣苔属(Primulina Hance)一种多年生草本植物,对于弱光、贫瘠的洞穴环境适应能力非常强,在物种进化和对环境的适应上独具特色。湖南报春苣苔花繁艳丽,株形优美,具有极佳的园艺种植价值。但其生境特殊,分布范围极窄,仅在湖南省的一个县内有发现,估计野生种...