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Genetic Diversity and Phylogenetic Analysis of South-East Asian Duck Populations Based on the mtDNA D-loop Sequences
Duck Populations D-loop Region Haplotype Mitochondrial DNA Phylogeny
2016/12/28
The maternally inherited mitochondrial DNA (mtDNA) D–loop region is widely used for exploring genetic relationships and for investigating the origin of various animal species. Currently, domestic duck...
鸡mtDNA D-loop区单倍型簇频率与中国家鸡多母系起源研究
家鸡 mtDNA D-loop区 单倍型 聚类分析 频率 起源
2016/12/26
本研究旨在通过分析家鸡和原鸡D-loop区单倍型簇的区域性分布和频率揭示中国家鸡多母系起源的区域和传播途径。通过对1 347条鸡D-loop序列进行完全对比排序，共发现198种单倍型，聚成12个单倍型簇。分析结果显示，海岛型红色原鸡与家鸡和大陆型红色原鸡有明显差异；苏门答腊大陆型红色原鸡作为独立分支，也体现出与东南亚大陆型红色原鸡的区别。单倍型簇频率分析显示，Clade C代表的母系可能更早在东南...
为评价现有选育方式下的遗传结构现状及选育潜力，采用mtDNA D-loop序列差异分析技术，对埃及品系尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）的3个选育世代群体共80尾鱼开展世代间遗传结构变异分析。结果显示：1）3个世代群体中个体序列长度为552~555 bp，包括52个变异位点、12个单倍型，平均单倍型多样度（H）为0.569；2）3个世代群体的核苷酸多态性（Pi）分别为0.02...
贵州东北部黑叶猴种群mtDNA D-loop序列多态性
黑叶猴 线粒体控制区 单倍型 遗传多样性
2016/7/18
贵州东北部作为黑叶猴在中国的主要分布区之一，黑叶猴的数量在近 30 年急剧下降，栖息地破碎化严重，保护形势不容乐观。深入了解黑叶猴在贵州东北部地区地理种群的分子变异及遗传水平现状，可以为黑叶猴保护提供重要的依据。本文以黑叶猴的粪便、毛发为实验材料，利用线粒体DNA分子标记，对采自贵州东北部地区黑叶猴野生种群79个粪便样品和黔灵公园笼养种群22个粪便样品、5份毛发样品的线粒体控制区(mtDNA D-...
Genetic Diversity of mtDNA D-loop Polymorphisms in Laotian Native Fowl Populations
Native Fowl Genetic Variability mtDNA Maternal Origin
2016/5/16
Here, we studied the genetic diversity of native fowls in Laos by analyzing a mitochondrial DNA (mtDNA) sequence polymorphism. A 546-bp fragment of the mtDNA D-loop region was sequenced in 129 chicken...
Phylogenetic Analysis of a Privately-owned Korean Native Chicken Population Using mtDNA D-loop Variations
D-loop Variation Haplotype Korean Native Chicken mtDNA
2016/5/11
The use of Korean native chicken is increasing, and the discovery of new genetic resources is very important from both economic and genetic conservation points of view. In this study, mtDNA D-loop seq...
Genetic Diversity of mtDNA D-loop and Maternal Origin of Three Chinese Native Horse Breeds
Chinese Western Native Horses Mitochondrial DNA D-loop Genetic Diversity Maternal Origin
2016/5/10
In order to protect the genetic resource of native horse breeds, the genetic diversity of mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop of three native horse breeds in western China were investigated. Forty-three ...
家鸭、媒鸭和野鸭mtDNA D-loop区的遗传变异
鸭 D-loop 遗传多样性 系统进化
2013/12/3
旨在从mtDNA水平探讨我国家鸭的遗传多样性及家鸭与野鸭间的亲缘关系。运用DNA测序方法，测定了不同地域、水域和表型性状的9种家鸭（北京鸭、高邮鸭、巢湖鸭、绍兴鸭、连城白鸭、吉安红毛鸭、文登黑鸭、云南麻鸭、建昌鸭）80个个体、4 种媒鸭（西湖野鸭、钱江野鸭、枞阳媒鸭、媒头鸭）26个个体和斑嘴鸭8个个体，共计114个个体的mtDNA Dloop区 667 bp序列。9种家鸭单倍型多样度和核苷酸多样...
采用PCR技术对12条绵阳市野生黄鳝mtDNA D-loop区部分序列进行扩增和测序，对所得9个个体606 bp的核甘酸片段序列进行遗传变异和系统进化分析：9条野生黄鳝D-loop序列的四种核苷酸组成中，T和C的组成频率为固定值，而A和G的频率有一定的差异；A+T的平均组成频率(57%)显著高于C+G的频率(43%)。从9条D-loop序列中一共检测到了5个多态位点，占总核苷酸序列总数(606 b...
采用ＰＣＲＲＦＬＰ方法，对采自安徽怀远、河南范县及安徽舒城的３个群体共１１２尾泥鳅（Ｍｉｓｇｕｒｎｕｓａｎｇｕｉｌｌｉｃａｕｄａｔｕｓ）线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）的Ｄｌｏｏｐ区段进行ＰＣＲ扩增，使用１１种核酸限制性内切酶进行酶切。结果显示，在１１种内切酶中，８种有酶切位点，４种存在个体间变异，共产生７种单倍型。怀远、范县和舒城群体的核苷酸多样性指数为０．００３３、０．００８３、０．００１１，单...
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析
云南文山 黄牛 mtDNA D-loop区 遗传多样性
2009/10/21
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析。
太湖鲢鱼mtDNA D-loop区遗传多样性
鲢鱼 mtDNA D-loop区 遗传多样性
2009/7/20
采用聚合酶链式反应(PCR)技术对太湖鲢鱼的mtDNA D-loop序列进行扩增，获得了大小约为500 bp的扩增产物。PCR产物经纯化后克隆到pMD19-T Vector进行序列鉴定测序，得到了520 bp的核苷酸片段(除去引物及部分端部序列)。用CLUSTAL X(1.83)软件进行排序比较，在30个个体中，共检测到52个变异位点，包括1个碱基缺失、36个转换位点、15个颠换位点及1个转换与颠...
婆罗门牛mtDNA D-loop变异及其遗传背景
婆罗门牛 mtDNA D-loop多态性 遗传背景
2009/6/23
对10头原种婆罗门牛mtDNA D-loop全序列912 bp测序，婆罗门牛遗传多样性丰富，检测到的9种单倍型兼有瘤牛(B. indicus)与普通牛(B. taurus)的遗传背景，核苷酸变异率为6.25%，单倍型多态度为0.978±0.054，核苷酸多态度为0.014 30±0.008 68。所有单倍型聚为明显的两大分支，婆罗门牛的大部分单倍型为普通牛单倍型类群， 并占绝对优势(90%)，仅B...
中国7个绵羊品种mtDNA D-loop区序列的系统发育与起源研究
绵羊 线粒体DNA 控制区 起源
2008/8/21
为探讨中国绵羊的起源、进化及遗传多样性，对新疆、内蒙古、西藏、云南、宁夏、山东等地区7个地方绵羊品种和1个外来品种共59个体的线粒体D-loop全序列进行了测序分析。7个地方绵羊群体的单倍型多样度（Hd）和核苷酸多样度（π）分别平均为0.996 0和0.030 6，表明我国地方绵羊品种的控制区遗传变异丰富。系统发育和网络进化分析均将中国绵羊分为3个明显的支系，揭示中国绵羊存在3个独立的母系起源；并...