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ERF Gene Clusters: Working Together to Regulate Metabolism
ERF transcription factorgene clusterjasmonates specialized metabolism
2023/12/18
Plants produce structurally diverse specialized metabolites, including bioactive alkaloids and terpenoids, in response to biotic and abiotic environmental stresses. The APETALA2/ETHYLENE RESPONSE FACT...
元宝枫AP2/ERF基因功能研究取得新进展(图)
元宝枫 AP2 ERF 基因功能
2023/5/30
元宝枫(Acer truncatum Bunge),属槭树科(Aceraceae)槭树属(Acer),因翅果形状像“金锭元宝”而得名,其抗旱、节水性能力强,是太行山石质山区和黄土丘陵区域重要的造林树种。APETALA2/Ethylene Responsive Factor (AP2/ERF)在植物抵御非生物胁迫中起着关键作用,然而对于元宝枫AP2/ERF的功能却不清楚。
山西农业大学在ERF转录因子提高杨树抗旱能力研究方面取得新进展(图)
ERF 转录因子 杨树 抗旱能力
2022/3/30
2022年2月28日,林学院林木逆境与栽培研究小组在林学领域顶级期刊Tree Physiology(IF=4.196)杂志发表题为《PtaERF194 inhibits plant growth and enhances drought tolerance in poplar》研究论文。研究小组通过构建ERF转录因子基因PtaERF194过量表达和RNAi抑制表达载体进行杨树遗传转化,培育获得Pt...
白桦AP2/ERF家族基因的生物信息学分析
AP2/ERF 家族 生物信息学 转录因子 白桦
2021/7/13
从白桦转录组数据库中筛选出45条AP2/ERF家族蛋白,对其蛋白序列进行生物信息学分析和系统进化分析。结果表明,白桦AP2/ERF蛋白除了分为AP2、ERF、RAV和soloist家族外,还有2条蛋白不属于这些家族;不同组别白桦AP2/ERF蛋白在理化性质上存在差异;白桦AP2/ERF蛋白都含有磷酸化位点,但含有磷酸化位点的数量和种类上都有差异;白桦AP2/ERF蛋白大都定位在细胞核里,它们主要在...
枣AP2/ERF转录因子鉴定及其响应枣疯病植原体表达分析
枣 枣疯病 植原体 AP2/ERF转录因子
2020/9/14
利用生物信息学方法,从植物转录因子数据库和NCBI数据库中分别得到175和164个候选的枣AP2/ERF转录因子序列,使用DNAMAN软件进行序列比对、去除重复序列,采用SMART软件预测蛋白结构域发现,枣基因组中包含有145个AP2/ERF基因,其中ERF、AP2、RAV亚家族分别含有116个、23个、5个,另有1个独立基因。预测枣AP2/ERF转录因子氨基酸数量在111 ~ 692之间,分子量...
基于番茄基因组数据库的更新,系统地对番茄AP2/ERF超家族成员进行了更新,并对其进行了染色体定位、保守基序、基因结构和对灰霉菌及生长素胁迫响应的分析。共鉴定出141个ERF家族基因,其中新鉴定出的ERF亚家族成员42个;随机分布在12条染色体上,大都只含有外显子而无内含子,部分基因不同程度的受到灰霉菌和生长素处理的诱导表达。作为拟南芥AtERF109在番茄中的同源基因,SlERF.D.3的表达可...
用RT-PCR方法从‘大辣椒’蝴蝶兰叶片中克隆得到4个AP2/ERF家族基因,命名为PhAP2/ERF1 ~ PhAP2/ERF4。蛋白结构域和序列比对发现PhAP2/ERF1 ~ PhAP2/ERF4均含有1个AP2结构域, PhAP2/ERF2还含有1个B3结构域。进化树分析表明4个蛋白与兰科AP2/ERF家族成员亲缘关系最近,PhAP2/ERF1属于AP2/ERF家族DREB亚家族中的A1类...
小豆AP2/ERF基因家族鉴定及其应答锈菌侵染的表达分析
小豆 小豆锈病 豇豆单胞锈菌 转录因子
2020/9/2
为明确小豆VaAP2/ERF家族基因在小豆应答豇豆单胞锈菌(Uromyces vignae)侵染中的作用,本研究采用生物信息学方法从小豆基因组中鉴定VaAP2/ERFs家族基因186个,包括AP2(24个)、RAV(2个)、Soloist(1个)及ERF(159个)四个亚家族,其中ERF亚家族又可分为DREB和ERF两个亚类。基因结构分析发现,68.3%的VaAP2/ERFs基因不具内含子。保守基...
通过比较分析番木瓜ERF家族成员的系统进化关系、基本理化性质、保守基序、启动子顺式元件,结合分析番木瓜在乙烯利和乙烯抑制剂1–甲基环丙烯(1-MCP)处理下以及不同成熟期果肉的RNA-seq数据,筛选出22个ERF家族成员进行表达差异分析,最终比较得出两个处理数据中显著差异表达基因有18个,推测这些基因可能在番木瓜果实成熟过程中起重要作用。
14个苹果AP2/ERF转录因子基因的克隆与表达分析
苹果 AP2/ERF转录因子 序列分析 表达分析
2020/4/8
为探究AP2/ERF转录因子在苹果(Malus pumila Mill.)生长发育以及生物或非生物胁迫应答下的功能,本研究利用同源比对和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法,克隆苹果MdAP2/ERF全长cDNA序列并进行生物信息学分析。采用Array技术检测MdAP2/ERF在苹果16种不同组织中的表达情况,RNA-seq技术检测MdAP2/ERF在苹果斑点落叶病菌(Alternaria a...
为进一步研究番茄ERF转录因子调控植物抗逆的分子机理,本研究以番茄浙杂-301为试验材料,分别克隆获得2个乙烯反应元件结合蛋白基因SlERF83和SlERF109,并对其进行序列及表达分析。结果表明,番茄SlERF83和SlERF109基因分别含有678 bp和669 bp的开放阅读框,编码225和222个氨基酸,各含有1个保守的AP2结构域,属于亲水性蛋白。进化分析表明,这2个ERF转录因子均属...
ERF转录因子家族在甜菜块根发育中的功能分析
甜菜 块根发育 BvERF
2018/11/26
本研究以AP2/ERF保守结构域序列为检索序列在甜菜(Beta vulgaris)基因组数据中搜索并鉴定BvERF转录因子家族成员。通过系统分析, 发现甜菜基因组中共有68个BvERF家族基因, 系统进化分析将它们分为10个组。BvERF家族中15个成员与甜菜块根转入快速生长阶段有关, 其中Bv_ammr可能与甜菜丰产性能有关, Bv_ignp、Bv_sqfr和Bv_khde与苗龄113 d时丰产...
将参与柿果实低氧胁迫响应的异源基因DkERF9转化到切花菊‘九月九’植株中,经PCR检测,获得了5株过量表达(35S︰︰DkERF9)的阳性植株。进一步比较分析了35S︰︰DkERF9植株与野生型植株的耐淹水性,发现水培低氧胁迫处理2周后,35S︰︰DkERF9植株较野生型植物生长缓慢,根系生长和茎的伸长均受到显著抑制,叶片颜色较淡;移除水培低氧胁迫处理3周后,生长部分恢复,但是叶片颜色及整体长势...