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经过杀菌的发酵肠，仍有部分会变质，为探究其原因并进行控制而进行了以下试验。从商业发酵肠中分离获得1株耐热芽孢菌株B1，为构建控制技术，提高发酵肠安全水平，对该芽孢菌进行鉴定，并研究抗菌肽surfactin对其芽孢生长曲线的影响及盐类对surfactin灭活芽孢效果的影响。采用16S rDNA序列分析对该菌进行鉴定，并研究了不同浓度的NaCl和Na2HPO4?12H2O对surfactin灭活芽孢效...
基于16S rDNA序列的小贯小绿叶蝉共生细菌多样性研究
小贯小绿叶蝉 细菌 16S rDNA 多样性
2018/6/26
利用Illumina HiSeq技术, 对赤壁、大悟、武汉、咸安和英山5个茶园小贯小绿叶蝉地理种群的成虫共生细菌16S rDNA-V4变异区进行测序, 应用Uparse和RDP Classifier等软件统计和分析样本的物种组成、丰度和多样性。5个地区小贯小绿叶蝉成虫的16S rDNA基因序列文库共获得239 645条有效tags, 在97%相似阈值下将其聚类为3 403个OTUs。共注释到41个...
Pathogen Causing Phalaenopsis Soft Rot Disease – 16S rDNA and Virulence Characterisation
Erwinia/Dickeya chrysanthemi moth orchids detached leaf inoculation assay
2018/3/5
The pathogen causing Phalaenopsis soft rot disease and developed detached leaf inoculation methods were identified.
Based on its 16S rDNA sequences, the pathogen causing soft rot disease in Phalaenop...
黄蒿丛枝病植原体的鉴定及其16S rDNA序列分析
黄蒿丛枝病 葡萄黄化植原体 分子鉴定 16S rDNA序列分析
2018/12/29
黄蒿为菊科蒿属一、二年生草本植物, 在医学和植物病害生物防治方面具有重要价值。植原体是一类重要的病原物, 常引起丛枝、小叶、黄化、簇生等症状。从山东泰山山涧采集到表现丛枝症状的感病黄蒿植株, 以叶片总DNA为模板, 利用植原体通用引物对R16F2n/R2进行PCR扩增, 获得了大小为1 244 bp的片段, 与葡萄黄化(Stolbur)植原体(AF248959)和纸花黄化植原体(JX128698)...
利用16S rDNA基因及线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基Ⅰ（cytochrome oxidase subunit I gene，COⅠ）基因建立3种形态学特征相近的血蜱属蜱类-长角血蜱、褐黄血蜱及铃头血蜱的分子生物学鉴定方法，探讨它们的系统发生关系。 方法 在上海市动物体表采集寄生蜱，在解剖显微镜下进行形态学鉴定后，提取蜱样本基因组DNA，采用PCR方法从蜱基因组中扩增16S rDNA及COⅠ基因...
16S rDNA测序在呼吸机相关性肺炎痰液细菌多样性分析中的应用
呼吸机相关性肺炎 痰液 细菌培养
2014/10/17
用 16S?rDNA 测序研究呼吸机相关性肺炎 （ VAP）患者痰液中致病菌的种类和丰度，探讨VAP 病原学诊断的新方法。 方法 对 31 例 VAP 患者进行支气管肺泡灌洗，提取痰液标本细菌 DNA，进行聚合酶链反应 （ PCR）鉴定，同时进行痰液细菌培养。利用 16S?rDNA 测序技术进行宏基因测序及生物信息学分析，并将测序结果与细菌培养结果比较。
来源于湖北省枣疯病植原体分离物16S rDNA和rp基因的序列分析
枣疯病 16S rDNA rp基因 进化树分析
2014/3/16
以田间采集的来源于我国湖北省枣树产业主产区随州市随县种植的表现为“枣疯病”症状的枣树分离株为试材, 对其16S rDNA和核糖体蛋白(ribosomal protein, rp)基因采用Nested-PCR进行扩增以及序列分析。结果表明, 湖北JWB-Hubei植原体分离物16S rDNA基因的核苷酸序列与我国山东、河南等地的分离株一致率均为99%以上, 在进化树中位于同一亚组的不同进化分支;虚拟...
从合浦珠母贝（Pinctada fucata）粘液中分离纯化得到一株抗菌物质产生菌F9，利用16S rDNA方法鉴定该菌株为棒状乳杆菌（Lactobacillus coryniformis）。通过琼脂扩散法测定了该菌的抑菌谱，发现该菌发酵液上清液在排除有机酸和过氧化氢(H2O2)的影响后仍对金黄色葡萄球菌（Staphyloccocus aureus）等多种食源性致病菌有明显的抑菌作用。对该菌发酵液...
利用柑橘黄龙病菌的特异引物，对采自云南红河州建水县和个旧市、玉溪市华宁县、大理州宾川县、昭通市盐津县、德宏州瑞丽市以及保山市隆阳区等地共151个疑似柑橘黄龙病样品进行了黄龙病菌的检测，其中建水县有5个样品检测结果为阳性，检出率为33.3%；个旧市、华宁县和宾川县各有1个样品为阳性，检出率分别为8.3%，5.5%，6.7%；而昭通、德宏和保山的样品均为阴性。表明黄龙病在云南的主要柑橘产区建水、个旧、...
用地衣红-卡红染色进行共生菌的形态观察，鉴定棘阿米巴CB/S1内共生细菌。克隆内共生细菌的16S rDNA基因，进行基因序列分析。结果表明，经地衣红-卡红染色棘阿米巴CB/S1内共生细菌呈黑色和棒状，在胞质内不规则分布。棘阿米巴CB/S1内共生细菌的16S rDNA基因长1 534 bp，与类亚洲嗜阿米巴杆菌（Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2）和韩国棘阿米...
Novel Bacteriocinogenic Lactobacillus plantarum Strains and Their Differentiation by Sequence Analysis of 16S rDNA, 16S-23S and 23S-5S Intergenic Spacer Regions and Randomly Amplified Polymorphic DNA Analysis
bacteriocin gene differentiation Lactobacillus plantarum ribosomal intergenic spacer region
2011/2/24
Six strains of bacteriocinogenic Lactobacillus plantarum (TL1, RG11, RS5, UL4, RG14
and RI11) isolated from Malaysian foods were investigated for their structural bacteriocin
genes. A new combinatio...
Wolbachia是一类胞质遗传的内共生菌, 广泛分布于节肢动物和其他动物中, 与宿主的生殖调控密切相关。通过研究迁飞性害虫稻纵卷叶螟Cnaphalocrocis medinalis (Guenée)的Wolbachia感染情况, 为探讨Wolbachia在迁飞性昆虫中的生殖调控和传递方式等提供基础资料。本研究应用Wolbachia的ftsZ基因和16S rDNA基因的特异性引物, 通过PCR扩增...
昆虫消化道内是一个复杂的微生态系统， 有大量的微生物存在。这些微生物对寄主发育、 营养吸收和防御方面都起着重要的作用。本文利用基于16S rRNA基因的PCR-RFLP指纹图谱法和变性梯度凝胶电泳（denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE）的方法对柑桔黄龙病虫-媒柑桔木虱Diaphorina citri体内细菌菌群多样性进行了研究。经PCR-RFL...
［目的］对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。［方法］对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA进行分析，对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个Ⅰ类内含子二级结构模型的构建。［结果］橡胶藻16S rDNA在639位点（E.coli序列编号）有一个46bp的插入片段，该片段能形成一个完美的双发夹结构，对16S rDNA的正常折叠不会产生...
水稻是宁夏地区主要粮食作物, 水稻种植也具有维持生态系统平衡, 防止土地荒漠化等重要的生态功能。而稻田土壤细菌是维持土壤生态功能的基础。但长期以来缺乏对干旱地区稻田土壤细菌多样性的认识。本研究采用非培养技术提取稻田土壤样品总DNA, 构建其16S rDNA克隆文库, 用PCR-RFLP分析进一步测序后聚类分析细菌群落的多样性。从稻田土样中分离获得了大于23 kb的DNA片段。PCR-RFLP共得到...