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猪脂肪组织表达序列标签(ESTs)的研究
猪 脂肪 cDNA文库 表达序列标签
2008/8/22
对猪脂肪组织cDNA文库的2104个克隆进行EST研究,其中563个ESTs在猪种中已有匹配序列,682个在人类及其它物种中可以找到同源序列,376个ESTs为未知新基因,有298个因序列质量差无法做分析,185个在EST库中有同源序列。所分析的376个新ESTs中,其中有159个具有ORF结构,43个具有Poly(A)和CpG特征,这些结果初步显示了猪脂肪组织的功能基因表达特点。
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摘要以久仰香猪、剑白香猪和长白猪3个品种的脾脏为材料，以品种间同一组织不同的发病状态为对照，将DDRT-PCR技术与银染法相结合进行差异显示研究，筛选与仔猪腹泻抗性相关的特异表达ESTs。在脾脏未发病RNA池中检测到5条特异表达ESTs，其中一条与Nck转导蛋白同源，一条与长散布元件反转录酶同源，一条为相似性较高的未知功能序列，两条为新序列。
猪脂肪组织表达序列标签（ESTs）大规模测序及分析
表达序列标签 测序 主组织相容性抗原
2008/1/29
摘要 利用大规模DNA序列测定的方法，对猪脂肪组织进行了表达序列标签（Expressed Sequence Tag，EST）序列测定，获得高质量EST共7790个，并对此进行了初步分析。使用STACK_PACK软件进行聚类分析,得到4354个基因聚类，包括3 609个单拷贝基因和745个多拷贝基因；将候选基因序列用BLASTN与nr库进行比较（e＝1e-10），从4 354个候选基因中得到271...
通过构建香猪肌肉组织cDNA文库，并在文库中随机挑选克隆进行测序的方法，获得了131个香猪肌肉EST序列。在这131个EST序列所代表的109个单一克隆中，有99个为人类及其他物种的同源序列，3个为已知的猪的ESTs，7个为未知ESTs。对这10个已知、未知ESTs进行开放阅读框预测并进行BlastX分析，没有找到高度同源的氨基酸序列。对上述EST所对应的基因功能分析结果表明，除去27.27%的E...
猪脂肪组织表达序列标签(ESTs)的研究
猪 脂肪 cDNA文库 表达序列标签
2010/1/29
对猪脂肪组织cDNA文库的2104个克隆进行EST研究,其中563个ESTs在猪种中已有匹配序列,682个在人类及其它物种中可以找到同源序列,376个ESTs为未知新基因,有298个因序列质量差无法做分析,185个在EST库中有同源序列。所分析的376个新ESTs中,其中有159个具有ORF结构,43个具有Poly(A)和CpG特征,这些结果初步显示了猪脂肪组织的功能基因表达特点。
猪脂肪组织表达序列标签(ESTs)的研究
猪 脂肪 cDNA文库 表达序列标签
2010/3/16
对猪脂肪组织cDNA文库的2104个克隆进行EST研究,其中563个ESTs在猪种中已有匹配序列,682个在人类及其它物种中可以找到同源序列,376个ESTs为未知新基因,有298个因序列质量差无法做分析,185个在EST库中有同源序列。所分析的376个新ESTs中,其中有159个具有ORF结构,43个具有Poly(A)和CpG特征,这些结果初步显示了猪脂肪组织的功能基因表达特点。