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枣AP2/ERF转录因子鉴定及其响应枣疯病植原体表达分析
枣 枣疯病 植原体 AP2/ERF转录因子
2020/9/14
利用生物信息学方法，从植物转录因子数据库和NCBI数据库中分别得到175和164个候选的枣AP2/ERF转录因子序列，使用DNAMAN软件进行序列比对、去除重复序列，采用SMART软件预测蛋白结构域发现，枣基因组中包含有145个AP2/ERF基因，其中ERF、AP2、RAV亚家族分别含有116个、23个、5个，另有1个独立基因。预测枣AP2/ERF转录因子氨基酸数量在111 ~ 692之间，分子量...
基于番茄基因组数据库的更新，系统地对番茄AP2/ERF超家族成员进行了更新，并对其进行了染色体定位、保守基序、基因结构和对灰霉菌及生长素胁迫响应的分析。共鉴定出141个ERF家族基因，其中新鉴定出的ERF亚家族成员42个；随机分布在12条染色体上，大都只含有外显子而无内含子，部分基因不同程度的受到灰霉菌和生长素处理的诱导表达。作为拟南芥AtERF109在番茄中的同源基因，SlERF.D.3的表达可...
用RT-PCR方法从‘大辣椒’蝴蝶兰叶片中克隆得到4个AP2/ERF家族基因，命名为PhAP2/ERF1 ~ PhAP2/ERF4。蛋白结构域和序列比对发现PhAP2/ERF1 ~ PhAP2/ERF4均含有1个AP2结构域， PhAP2/ERF2还含有1个B3结构域。进化树分析表明4个蛋白与兰科AP2/ERF家族成员亲缘关系最近，PhAP2/ERF1属于AP2/ERF家族DREB亚家族中的A1类...
通过比较分析番木瓜ERF家族成员的系统进化关系、基本理化性质、保守基序、启动子顺式元件，结合分析番木瓜在乙烯利和乙烯抑制剂1–甲基环丙烯（1-MCP）处理下以及不同成熟期果肉的RNA-seq数据，筛选出22个ERF家族成员进行表达差异分析，最终比较得出两个处理数据中显著差异表达基因有18个，推测这些基因可能在番木瓜果实成熟过程中起重要作用。
将参与柿果实低氧胁迫响应的异源基因DkERF9转化到切花菊‘九月九’植株中，经PCR检测，获得了5株过量表达（35S︰︰DkERF9）的阳性植株。进一步比较分析了35S︰︰DkERF9植株与野生型植株的耐淹水性，发现水培低氧胁迫处理2周后，35S︰︰DkERF9植株较野生型植物生长缓慢，根系生长和茎的伸长均受到显著抑制，叶片颜色较淡；移除水培低氧胁迫处理3周后，生长部分恢复，但是叶片颜色及整体长势...
调控黄瓜苦味基因Bi的AP2/ERF家族转录因子
黄瓜 苦味 酵母单杂交 烟草瞬时表达 AP2/ERF转录因子
2014/6/13
从华北型黄瓜‘9930’中克隆了黄瓜苦味形成的关键基因Bi的启动子序列，通过酵母单杂交技术对黄瓜叶片cDNA文库进行筛选，寻找可以调控Bi表达的转录因子。通过对筛选结果的测序及比对，发现有7种转录因子重复出现，包括2个AP2/ERF家族、3个bZIP家族、1个WRKY家族转录因子和1个E3泛素类COP1蛋白。其中AP2/ERF家族转录因子CsERF（登录号：Csa7M448110）重复出现6次，出...