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中国科学院科学家揭示真核生物焦亡蛋白GSDM非酶切依赖的全新激活机制（图）
真核生物 蛋白 细菌
2024/4/26
细胞焦亡是由gasdermin（GSDM）家族蛋白介导的程序性细胞死亡，在机体抵御病原感染、清除变异或有害细胞等过程中发挥作用。作为细胞焦亡的直接执行者，GSDM蛋白备受关注。哺乳动物的GSDM蛋白具有保守的自抑制双结构域特征，发挥抑制作用的C端结构域通过与N端效应结构域的分子内相互作用，将全长蛋白锁定在非激活态。GSDM蛋白的激活需要上游专门的蛋白酶特异性切割，释放N端效应结构域并在细胞膜上寡聚...
2021年11月10日，中国科学院大连化学物理研究所复杂分子体系反应动力学研究组（1101组）韩克利研究员团队基于氨基甲酸酯母核的结构与功能关系，设计并发展了小分子抑制剂型荧光探针（SMI-probe），在重要的药物代谢酶羧酸酯酶（Carboxylesterases，CEs）的实时荧光高分辨检测中取得了良好的应用效果。由于抑制剂型探针分子NIC-4的分子结构简单，体积小，且具有针对CEs的超分辨响...
于涵洋课题组在非天然核酸酶方面取得新进展（图）
非天然核酸酶 RNA连接酶 TNA酶 T8-6
2022/6/1
核酸是生命体的基本组成成分，包括DNA和RNA。其中细胞内的RNA既可以存储和传递遗传信息，又能够催化生物化学反应。RNA具有丰富的生物功能多样性，促使研究生命起源的科学家提出了“RNA世界假说”，认为在地球生命演化的早期，存在仅依赖于RNA的生命形式。但是RNA是不是唯一可能的遗传物质呢？为了探索这个问题，Eschenmoser等合成了一系列RNA类似物并研究了其基本的物理和化学性质。在这项研究...
2020年3月30日，国际学术期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》）在线发表了我校生命学院刘如娟课题组与特聘教授王恩多课题组[中科院分子细胞科学卓越创新中心（上海生物化学与细胞生物学研究所）]最新研究成果“Molecular basis of the multifaceted functions of human leucyl-tRNA synthetase in pro...
近日，我校物质学院季泉江课题组与复旦大学甘建华课题组合作，通过晶体结构解析、细菌基因编辑以及体外DNA切割等手段,阐明了一种具有高保真和广PAM特性的新型Cas9蛋白——xCas9蛋白的化学工作机理。该研究成果以“Molecular basis for the PAM expansion and fidelity enhancement of an evolved Cas9 nuclease”为题...
Dna2核酸酶的缺乏导致染色体断裂处频繁插入复杂DNA片段
Dna2核酸酶 染色体 断裂处 复杂DNA片段
2018/12/19
2018年12月5日，美国贝勒医学院和康奈尔大学等科研人员在Nature上发表了题为“Dna2 nuclease deficiency results in large and complex DNA insertions at chromosomal breaks”的文章，通过对Dna2核酸酶缺乏的酵母突变株的研究，发现Dna2核酸酶缺乏导致染色体断裂处的大而复杂的DNA片段的频繁插入，破坏了染...
复旦大学生命科学学院甘建华课题组、李继喜课题组合作研究发现线粒体核酸酶MGME1介导DNA降解机制（图）
复旦大学生命科学学院 甘建华 课题组 李继喜 线粒体 核酸酶 MGME1介导 DNA 降解机制
2018/10/22
近日，生命科学学院甘建华教授课题组、李继喜教授课题组的合作研究解析了人源线粒体核酸酶MGME1与二价金属锰离子及DNA底物的复合物结构，阐明了MGME1识别不同底物DNA并介导DNA降解的分子机制，有助于进一步理解MGME1缺陷引起相关线粒体疾病的发生机制。9月21日，研究成果以《源线粒体核酸酶MGME1介导DNA降解的结构基础》（“Structural insights into DNA deg...
上海交通大学医学院余健秀课题组在《核酸研究》发表论文——首次揭示蛋白质修饰调控RNA-m6A修饰的关键酶METTL3催化功能的分子机制（图）
上海交通大学医学院 核酸研究 蛋白质 RNA-m6A修饰 关键酶METTL3 催化功能 分子机制
2018/3/7
上海交通大学医学院生化与分子生物学系余健秀课题组在国际著名学术杂志《核酸研究》（NucleicAcids Research）（影响因子10.162）在线发表了题为“SUMOylationof the m6A-RNA methyltransferase METTL3 modulates its function”论文。该研究首次揭示SUMO化修饰调控m6A修饰的关键酶METTL3催化功能的一种新分子...
上海交通大学医学院余健秀组首次揭示蛋白质修饰调控RNA-m6A修饰的关键酶METTL3催化功能的分子机制（图）
上海交通大学医学院 蛋白质 RNA-m6A 关键酶 METTL3 催化功能 分子机制
2018/3/15
上海交通大学医学院生化与分子生物学系余健秀课题组在国际著名学术杂志《核酸研究》（Nucleic Acids Research）（影响因子10.162）在线发表了题为“SUMOylation of the m6A-RNA methyltransferase METTL3 modulates its function”论文。该研究首次揭示SUMO化修饰调控m6A 修饰的关键酶METTL3 催化功能的一...
2010年1月11日，美国《分子细胞生物学》（Molecular and Cellular Biology）杂志在线发表了miRNA导致mRNA降解机制的最新研究成果。该研究工作由上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚课题组和美国纽约大学Joel Belasco实验室共同合作完成，生化与细胞所研究生朴香花等研究人员承担了主要研究工作。
DNA拓扑异构酶Ⅱ与Ⅰ A的进化分析
DNA拓扑异构酶 CAP-like结构域 Toprim结构域 分子进化 催化机制
2009/6/25
DNA拓扑异构酶与断开DNA链和改变其拓扑结构有关。先前的研究认为，拓扑异构酶Type ⅡB是由Type ⅡA通过基因的复制、重组和缺失所造成。然而，本研究结果则显示，Type ⅠA与Type ⅡB的进化关系较近，而Type ⅡA与Type ⅡB的关系较远。因此，Type ⅡB可能是由Type ⅠA演化而来，或者说，Type ⅡB是Type ⅠA在古细菌中的特化形式；Type ⅡB可能是由Type...
DNA损伤监测及修复相关酶与细胞衰老
细胞衰老 DNA损伤监测 DNA损伤修复 tankyrase
2008/11/6
衰老是细胞的重要生命现象之一，衰老假说之一认为细胞中残留DNA损伤的积累可加速细胞的衰老.因此，细胞内DNA损伤监测及修复系统的正常运行与细胞衰老调控密切相关，DNA损伤监测及修复相关酶如PARP、DNA-PK、ATM、p53等在细胞衰老中的调控作用日益受到广泛关注.研究这些蛋白质分子间的相互作用及其在细胞衰老过程中的调控功能，有利于揭示DNA损伤应激、损伤修复调控与细胞衰老之间的内在联系，为抗...
小麦及其近缘物种中小分子量核糖核酸酶的初步分析
RNase 小麦 发芽种子 RNase功能胶
2008/2/7
摘要应用RNase功能胶体系,在小麦及其相关物种中发现1组小分子量核糖核酸酶(RNase)。RNase的分子量变化范围在6.5-14kDa间,低于已报道的大多数植物RNase的分子量。小分子量RNase在幼苗中大量表达,并且在降解RN A底物时,随着缓冲液pH值及离子浓度的不同而有所变化。在休眼及发芽小麦种子中发现几种可能不同的小分子量RNase。在发芽过程中,其中2种RNase的活性变化不明显,...
从小牛胸腺分离纯化末端脱氧核苷酸转移酶
转移酶 脱氧核苷酸 小牛胸腺
2008/2/5
摘要本文采用Okamura氏的寡聚脱氧胸苷酸(oligo dT-纤维素柱层析法分离纯化小牛胸腺末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)。包括下列主要步骤：制备酶粗提液、磷酸纤维素柱层析、二乙基氨基乙基纤维素柱层析、葡聚糖凝胶过滤、oligo dT-纤维素亲和层析。经过上述几步分离纯化，从500克小牛胸腺中获得6，564单位TdT，比活性达5，199单位/毫克蛋白，聚丙烯酰胺凝胶电泳呈一条带，不含脱氧核糖核酸...
蓖麻蚕核糖体核糖核酸基因的限制性内切酶酶切图谱1）
核糖核酸基因 蚕核糖体 蓖麻
2008/2/5
摘要用Sonthern 转移和分子杂交法研究了蓖麻蚕（Attacus ricini）
核糖体核糖核酸（rRAN）的基因（rDNA）的限制性内切酶酶切图谱。发现该rDNA是由分子量大约为 7.0×106 道尔顿的重复单位所组成。PsuI可以切出完整的重复单位。EcoRI、BamHI和BglII在重复单位内部都有切口。这与家蚕(Bombyx mori)的rDNA 是不同的。
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