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应用16SrDNA全序列测序技术鉴定生鲜乳中的细菌种类
生鲜乳 16SrRNA 细菌 鉴定
2016/6/29
采用玻璃珠法提取生鲜乳中分离的34株细菌基因组DNA,用细菌通用引物(27f/1492r)PCR扩增16S r DNA片段并测序,与Gen Bank数据库同源序列比对,系统发育树聚类分析,并结合形态学和生理学特征确定了34株菌的种属地位。结果表明,共鉴定出16个种属。3个生鲜乳样中细菌种类及其分布特点不同。其中1号样有7种细菌,以Acinetobacter sp.(不动杆菌属)为主,2号样有6种细...
黄颡鱼小肠结肠炎耶尔森氏菌１６ＳｒＤＮＡ及系统发育分析
黄颡鱼 小肠结肠炎耶尔森氏菌 １６ＳｒＤＮＡ 系统发育分析
2013/1/14
从发病黄颡鱼（Ｐｅｌｔｅｏｂａｇｒｕｓｆｕｌｖｉｄｒａｃｏ）心脏中分离到１株细菌ＧＭ２４０２，进行了分离培养、形态学观察、生理生化试验与１６ＳｒＤＮＡ基因的ＰＣＲ扩增及序列分析。结果表明，菌株ＧＭ２４０２为革兰氏阴性杆菌，具动力性，ＶＰ试验、水杨酸、过氧化氢酶、脲酶等阳性，不发酵鼠李糖、乳糖等，硫化氢、枸椽酸盐等阴性。１６ＳｒＤＮＡ序列长１４１７ｂｐ，ＧｅｎＢａｎｋ的登录号是ＪＸ１０１５９８，且...
齐口裂腹鱼维氏气单胞菌１６ＳｒＤＮＡ序列分析
齐口裂腹鱼 维氏气单胞菌 １６ＳｒＤＮＡ 系统发育分析
2013/1/15
从齐口裂腹鱼（Ｓｃｌｉｚｏｔｈｏｒａｘｐｒｅｎａｎｔｉ）肠道中分离出菌株Ｓｐｃ０４０８，采用常规形态特征的观察、生理生化试验、结合１６ＳｒＤＮＡ基因序列分析并构建系统发育树。结果表明，该菌为革兰氏染色呈阴性，短杆形，无芽孢；该菌理化特性为具有动力性，Ｈ２Ｓ、尿素阴性、不发酵木糖、鼠李糖、山梨醇等；β－半乳糖苷酶、葡磷胨水、枸橼酸盐阳性；其１６ＳｒＤＮＡ长度为１４４３ｂｐ，ＧｅｎＢａｎｋ数据库登录号...
拮抗放线菌111A202的种类鉴定及其16SrDNA序列分析
放线菌 鉴定 同源性 16SrDNA
2009/7/20
对分离自新疆棉花地土壤的一株拮抗放线菌菌株111A202进行了形态特征、培养特征、生理生化特征、细胞壁组分分析及16S rDNA序列分析。结果表明该菌基内菌丝无横隔、不断裂, 气生菌丝分枝、孢子丝波曲,孢子椭圆形，表面光滑。细胞壁化学组分Ⅰ型。以16S rDNA序列为基础构建了包括7株相关种属菌在内的系统发育树, 111A202与变铅青链霉菌(Streptomyces lividans)、微白黄链...
从分离自我国中东部地区紫穗槐、紫荆和紫藤 3种宿主根瘤菌中 ,选取 5 9个菌株和 2 9个参比菌株 ,对它们进行了 135个表型性状测定的数值分类分析和 16SrDNAPCR RFLP研究。试验结果表明 ,数值分类聚类在82 %相似性水平上、16SrDNAPCR RFLP聚类在 92 %相似性水平上均聚为 7个群 ,各宿主根瘤菌基本上按参比菌株各属归群。
以取自3头安装有永久性瘤胃瘘管的土种山羊的瘤胃内容物为材料,经过DNA抽提和PCR扩增,扩增产物利用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE,一种DNA指纹技术)分析瘤胃细菌在两种日粮条件下的多样性.同时利用基因序列分析技术,分析了16个在DGGE胶上有匹配带的克隆的16S rDNA序列,并与现有的数据库进行了比较.结果表明,饲喂基础日粮时3头山羊瘤胃内容物的DGGE图谱有一定的相似性(43%～55%);饲...
竹丛枝植原体16SrDNA片段克隆与序列分析
2007/12/6
专著信息
书名
竹丛枝植原体16SrDNA片段克隆与序列分析
语种
中文
撰写或编译
作者
蔡 红,张华明,陈海如
第一作者单位
出版社
植物保护,31(2):38-41,2005
出版地
出版日期
2005年
月
日
标准书号
介质类型
页数
字数
开本
相关项目
云南植原体及所致病害的分子鉴定和种类保存
从分离自我国中东部地区紫穗槐、紫荆和紫藤 3种宿主根瘤菌中 ,选取 5 9个菌株和 2 9个参比菌株 ,对它们进行了 135个表型性状测定的数值分类分析和 16SrDNAPCR RFLP研究。试验结果表明 ,数值分类聚类在82 %相似性水平上、16SrDNAPCR RFLP聚类在 92 %相似性水平上均聚为 7个群 ,各宿主根瘤菌基本上按参比菌株各属归群。其中绝大多数紫穗槐根瘤菌归属于中慢生根瘤菌...